python 从fastq文件中挑选出序列长度在规定范围的序列

要求：

FASTQ文件长度过滤：编写一个程序，读取FASTQ文件，过滤掉碱基序列长度在60-80之外的序列，将长度在60-80之内的序列输出到结果文件中。

FASTQ格式文件如下：每四行表示一个测序序列，第二行是碱基序列。

@M2,HWI-7001455:326:HGTFVADXX:1:1101:2666:105721:N:0:GCGCTA

TTTAGTTTTGTAGTAATTGTTTGTAGTAAAATTTGTATTAGTTTTTTTATTTGTA

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CCCFFFDDHHFHHIJJJJJHHIJJJJIIGEIJIJJIIJJJJHIJJJJJIJIJIHI

编程要求如下:

1)      程序命名为fq_filter.py

2)      程序采用optparse从命令行输入，参数共有3个，-infile，-outfile，-h；

3)      其中-infile用于接收输入的FASTQ文件名；

4)      -outfile用于给出符合条件的结果文件名，输出结果格式要与输入的FASTQ格式相同。

5)      -h用于给出程序的使用说明；

fq_filter.py

#!/usr/bin/python
from optparse import OptionParser


parser = OptionParser()
parser.add_option("--infile", dest="infile", help="give a fasta fil