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原创 PyMOL简单操作图文介绍
关于PyMoL简单的命令行操作及鼠标操作。PyMOL可以参考这篇文章:https://cloud.tencent.com/developer/news/338169提示:以下是本篇文章正文内容,下面案例可供参考一、pandas是什么?示例:pandas 是基于NumPy 的一种工具,该工具是为了解决数据分析任务而创建的。二、使用步骤1.引入库代码如下(示例):import numpy as npimport pandas as pdimport matpl
2022-09-09 17:35:09 3094
原创 Discovery Studio Visualizer简单操作
Discovery Studio Visualizer简单操作 + PDB文本文件介绍
2022-09-08 16:30:27 6951 1
翻译 Phenix图文流程:使用docking解决Cryo-EM数据的结构问题
翻译自:https://phenix-online.org/documentation/tutorials/cryo_em_structure_solution_docking.htmlTutorial: Solving a structure with cryo-EM data using docking教程:使用docking解决Cryo-EM数据的结构这个例子是cryo-EM map的密度修改density modification,然后是通过对接docking同源结构进行可选的结构确定。数.
2021-09-16 17:01:13 3602
翻译 Coot Cryo-EM教程2:Fitting和Mutating
Coot Cryo-EM教程2:Fitting和Mutating翻译自:https://pemsley.github.io/coot/blog/2020/10/20/Coot-Cryo-EM-main.html本教程专为0.9.1或更高版本而设计。目的:我们将fit Cleavage and Polyadenylation Factor的domain1: Setting Up1.1 Fetch the Files使用Web浏览器下载EMD-3908 bundle:http://www.ebi
2021-09-09 16:23:22 8469
翻译 ChimeraX cryoEM 可视化教程:细菌ATP合酶
ChimeraX cryoEM 可视化教程:细菌ATP合酶翻译自:https://www.rbvi.ucsf.edu/chimerax/data/stanford-jul2019/tutorial.html这篇ChimeraX教程将着眼于如何可视化细菌ATP合成酶在3.0和3.2 A分辨率下由CryoEM测定的三种构象的原子模型和maps。我们将创建与2019年2月出版物中类似的数据视图。原子模型PDB 6n2y、6n2z、6n30。EMDB map 9333,9334,9335。ChimeraX
2021-09-04 15:12:51 5648
翻译 Chimera的简单应用_图文流程
UCSF Chimera的简单应用翻译自:https://dasher.wustl.edu/bio5357/software/chimera/chimera-getting-started.pdfFetch打开 File→Fetch by ID and type 1zik in the PDB ID field1zik是由两个肽形成的亮氨酸拉链: Presets→Interactive 2 (all atoms)应用交互式预置#2,这将按元素显示除碳以外的所有原子和颜色代码原子(氧红色、
2021-08-28 11:04:23 10673
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