从贻贝中分离和鉴定具有成骨活性肽段的研究

摘要：本文主要研究贻贝中具有成骨活性的短肽。通过将分解贻贝中的肽，获得肽段后通过DS中的基于分子对接(CDOCKER)的虚拟筛选，发现了一种新的短肽YPRKDETGAERT能够与整合蛋白形成很好的相互作用，并通过实验验证了其具有很好的成骨活性，为功能性食品工业中成骨肽的制备和应用提供了理论和实践上的依据。

分子对接（molecular docking）是基于结构药物设计的核心模拟手段，依据受体与配体作用时的几何匹配和能量匹配过程，模拟受体-配体相互作用，预测两者间最佳的结合模式和结合亲和力。采用分子对接模拟技术，科研人员可以进行基于结构的药物虚拟筛选，药物分子的结构改造，药靶相互作用的机理研究等工作，从而大大提高实验效率。在Discovery Studio这一分子模拟的综合平台中，共有四种对接程序，包含Libdock、CDOCKER、FlexibleDocking，这三种对接算法各有优势，能够满足广大科研工作者的多种应用需求，为其提供配体受体间相互识别的“利器”。

从贻贝中分离和鉴定具有成骨活性肽段的研究 

ref：J. Agric. Food Chem；IF=3.412

链接： 10.1021/acs.jafc.8b06530.

骨是由骨吸收和骨形成的动态过程高度调控的动态生物结构组织。骨的形成是一个复杂的过程，涉及许多生物因素的结合。一些生物活性肽或蛋白对骨再生有促进作用，可能影响骨、结缔组织和上皮细胞的粘附、增殖和分化。贝类去壳过程与骨形成过程的机理相似。贻贝是一种营养丰富的海产品。贻贝的水溶性蛋白在干燥条件下占总质量的65%，其中一些可以通过酶解转化为生物活性肽。一些研究表明，由于其高蛋白含量，这种海鲜有很多健康益处。本文主要研究贻贝中具有成骨活性的短肽。通过将水解贻贝中的肽，获得肽段，通过DS中的基于分子对接(CDOCKER)的虚拟筛选，发现了一种新的短肽YPRKDETGAERT能够与整合蛋白形成很好的相互作用，并通过实验验证了其具有很好的成骨活性，为功能性食品工业中成骨肽的制备和应用提供了理论和实践上的依据。

 

图一 短肽与整合素蛋白的相互作用模式。

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