原反补移码-CSDN博客

原创 2020-12-10周报

一、做了实验，发现自己单用decoder（配准）来训练配准参数。效果也不是很提升明显。lspigSummaryDice score: 0.6597795844078064 (0.09940144419670105)Jacc score: 0.3953123986721039 (0.09658797830343246)Jacobian determinant: 0.004486850928515196 (0.0003765725123230368)sliverSummaryDi

2020-12-10 14:15:49 183

原创 2020-12-3周报

一、实验 1. 训练两个Decoder，共享一个Encoder。其中配准的Decoder网络的损失由两部分组成一个是regulation loss 和 similarity loss。第二个Decoder用的是similarity loss。其中similarity loss可以有很多，比如NCC，MSE等。我采用的是级联递归网络那文章中的代码采用的。其中用NCC和MSE的实验还在跑，因为是3D图像，所以速度很慢。而且还两次都莫名其妙被kill 过两次。下面是四个数据集跑出来的结果。相比...

2020-12-03 11:27:06 208

原创 Recursive Cascaded Networks for Unsupervised Medical Image Registration

一、Motivation本文的中心思想是基于：采用级联的方式逐次对图像进行逐渐配准。每一个级联网络都能将输入的Moving Image -》warped Image。作为下一个级联网络的Moving Image。上图所展示就是本文章的级联递归配准的思路。二、Method级联递归：多个级联递归网络，每一个级联递归网络分别对此网络的输入，进行变换。得到下一级网络的输入Moving Image。最后一个级联网络的输出计算损失，反向传播来更新网络中的参数。那么文章中每一个级联网络的网络结

2020-05-09 19:07:52 1139

原创 Multi-Temporal Remote Sensing Image Registration Using Deep Convolutional Features

ABSTRACT 多时相遥感图像被广泛应用于军事和民用领域，比如地面目标识别、城市发展评估以及地理变化评估。地面变化对特征点在数量和质量上的检测具有一定的挑战，这是基于特征点检测的配准算法所面临的常见的困难。在严峻的外观变化下，检测到的特征点可能包含大量的外点，而内点可能也分布不适当且不均匀。本文提出了一种基于卷积神经网络（CNN）特征的多时相遥感图像配准方法，两个关键的贡献如下：(1)我...

2020-04-26 17:00:49 2933 13

原创 NON-RIGID IMAGE REGISTRATION USING SELF-SUPERVISED FULLY CONVOLUTIONAL NETWORKS

一、特点自监督（相似性度量） multi-resolution image registration framework二、Method本文的框架如下图所示：可以看到网络的输入是Moving image and Fixed Image。loss 是多级loss。其中在不同的网络部分计算一个Dvloss。其中网络的回归输出（reg）用卷积来模拟回归输出。回归层的输出大小和输入...

2020-04-26 16:57:53 578 2

原创 Deformable MRI-Ultrasound Registration Using 3D Convolutional Neural Network

一、Motivation不同模态的图像之间强度分布存在差异，因此现存的配准算法不具备很强的鲁棒性。无监督且端到端包含三个部分：特征提取、变形场生成器、空间变换采样。该方法同时考虑了图像强度和梯度，避免了基于强度的相似性度量的缺点。二、Method上图是整个算法的框架，两个全卷机网络作为特征提取器。分别输入MRI and IUS图像。然后两个特征提取器的输出concat...

2020-04-11 15:44:36 502

原创 ELASTIC REGISTRATION OF MEDICAL IMAGES WITH GANS

一、Motivation我们的方法使用生成式对抗网络(GANs)，消除了耗时的迭代方法。直接预测变形场用于图像配准二、Method作者首先提到现有几种Gan的缺点。Conditional Gans(cGANs)在cGANs中，输出取决于输入图像和随机噪声向量，需要训练图像对。 cyclic GANs (cycGANs) cycGANs不需要训练图像, 但加强变形场的一致性...

2020-04-03 20:09:57 415 1

原创 AIRNet: Self-Supervised Airnet Registration for 3D Medical Images using Neural Networks

一简单介绍因为在看那篇配准文章提到Shape context，所以就找到该文章看了下。主要是了解Shape Context是什么。二原理在此文中将一个目标看做是一个点集，且用来做匹配的集合是该点集的一个子集。可以用边缘检测器产生。。如下图所示：对于每一个点在形状（a）中，希望找到一个点在形状（b）中。这就成为了一个匹配问题。作者把什么定义为描述...

2020-03-28 19:42:10 729

原创 BIRNet: Brain image registration using dual-supervised fully convolutional networks

一、Motivation缺乏准确的Ground-Truth。we design a fully convolutional network that is subject to dual-guidance。1) Ground-truth guidance using deformation fields obtained by an existing registration m...

2020-03-21 09:19:50 1041 1

原创 Adversarial Image Registration with Application for MR and TRUS Image Fusion

一、Motivation1磁共振（MR）和经直肠超声（TRUS）图像配准是MR-TRUS融合的关键组成部分。2.由于图像外观之间的巨大差异以及图像对应关系的较大差异。3提出了对抗图像配准（AIR）框架。通过同时训练两个深度神经网络，一个是生成器，另一个是判别器。4而且还有一个度量网络，可以帮助评估图像配准的质量。5但是，多模式图像配准是一项非常艰巨的任务，因为很难定义...

2020-03-12 12:08:14 611

原创 Adversarial Similarity Network for Evaluating Image Alignment in Deep Learning based Registration

一、Motivation1.传统的配准方法试图基于基于强度的相似性度量来优化变形场。这些方法通常涉及计算量大的高维优化和与任务有关的参数调整。2. 最近的基于CNN的有监督配准方法虽然能够一定程度上解决传统方法的缺点，但是受限于ground-truth的真实性。3. 在无监督的CNN方法利用相似性指标作为损失函数的一部分，这些相似性指标与图像的性质密切相关，可能不适用于处理各种...

2020-03-07 11:49:52 1042

原创 Registration小结2

一、Nonrigid Image Registration Using Multi-scale 3D Convolutional Neural Networks1.基本方法首先人工生成DFV（位移矢量场），作为标签。训练CNN，CNN如上图所示。分别对fixed image 和 moving image取patch，输入到网络中。最终网络的输出就是一个DFV。这样训练好CNN，就可以对...

2020-02-29 16:11:12 712 1

原创 Rigistration小结

一、An Unsupervised Learning Model forDeformable Medical Image Registration1. 基本方法这篇文章利用类似于U-NET网络结构，将Fixed Image 和 Moving Image concate然后输入到网络中。其网络输出的Size是和输入图像相等的。也就是上图中的Registration Field，对每一个...

2020-02-15 14:21:42 1305

原创 DenseFuse: A Fusion Approach to Infrared and Visible Images

Abstract 在这篇文章中，我们提出一个新的深度学习网络结构来解决红外光和可见光之间的融合问题。与其它卷积神经网络相比，我们的编码网络由卷积层，融合层和密集块组合而成，其中每层的输出连接到每个其他层。我们尝试使用这种架构来获得更多编码过程中源图像的有用特征。并且设计了两种融合层（融合策略）来融合这些特征。最后，融合图像由解码器重建。与现有的融合方法相比，所提出的融合方法在客观...

2019-10-23 18:17:42 2329

原创《An Unsupervised Learning Model for Deformable Medical Image Registration》

Abstract 我们提出了一种基于快速学习的算法，用于可变形的成对3D医学图像配准。当前的配准方法针对每对图像独立地优化目标函数，这对于大数据而言可能是耗时的。我们将配准定义为参数函数，并根据感兴趣的集合给出一组图像来优化其参数。给定一对新的扫描图像，通过直接使用已经学习好了的参数的函数直接评估，我们能够快速计算配准区域。我们使用CNN对此函数进行建模，并使用空间变换图层从另一个图像重...

2019-10-23 18:15:50 1014

原创 Windows10下安装Tensorflow-GPU

只在特定环境下安装，其他环境没有测试过。一原料 1 Windows10系统主机 2 GTX1060显卡 3 可以上网二配料 1 Python3.6.6 下载地址：https://www.python.org/downloads/ 2 Cuda9.0 下载地址：https://developer.nvidia....

2019-04-20 20:46:58 352

原创 TensorFlow之Cifar10数据集训练

一 Cifar10数据集介绍该数据集共有60000张彩色图像，这些图像是32*32，分为10个类，每类6000张图。这里面有50000张用于训练，构成了5个训练批，每一批10000张图；另外10000用于测试，单独构成一批。测试批的数据里，取自10类中的每一类，每一类随机取1000张。抽剩下的就随机排列组成了训练批。注意一个训练批中的各类图像并不一定数量相同，总的来看训练批，每一...

2018-08-02 17:00:18 799

paopaovae的博客