文章发表丨求臻医学发布病理AI模型,实现肿瘤精准分型

近日,求臻医学科研团队研发一款基于数字病理图像的肿瘤分型深度学习模型—TMG(The Transformer-based Multiple instance learning with Global average pooling)。该模型可有效消除对病理图像细粒度标记的依赖,实现高准确率的分型,将用于原发灶不明肿瘤(CUP)的预测,助力肿瘤精准分型。目前,该研究成果已在线发表于国际生物信息学重要会议International Symposium on Bioinformatics Research and Applications(ISBRA 2023,波兰)。

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研究背景

病理诊断作为肿瘤诊断的“金标准”,是治疗方案选择和预后评估的首要环节,病理诊断结果的准确性对于患者的精准诊疗尤为重要。然而,仅依靠病理医生的传统病理诊断模式面临着诸多挑战,如高水平病理医生短缺、诊断结果易受到主观影响以及诊断报告获取耗时较长等问题。为应对这些挑战,智能化病理图像分析方法的开发迫在眉睫。


随着数字扫描技术的进步,病理图像数字扫描仪能够获取高分辨率的全视野病理组织切片(WSI),并完整地保留原始的组织结构。同时,基于深度学习的图像分类方法在自然图像和医学图像领域展现出了巨大的潜力和有效性。这些先进技术方法的应用使得病理图像的分析和诊断进入了一个全新的数字化和智能化的发展阶段。


然而,数字病理图像存在分辨率高、图像特征差异微小等特点,传统的深度学习方法并不适用于WSI的自动分类。现有常用方

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目标检测(Object Detection)是计算机视觉领域的一个核心问题,其主要任务是找出图像中所有感兴趣的目标(物体),并确定它们的类别和位置。以下是对目标检测的详细阐述: 一、基本概念 目标检测的任务是解决“在哪里?是什么?”的问题,即定位出图像中目标的位置并识别出目标的类别。由于各类物体具有不同的外观、形状和姿态,加上成像时光照、遮挡等因素的干扰,目标检测一直是计算机视觉领域最具挑战性的任务之一。 二、核心问题 目标检测涉及以下几个核心问题: 分类问题:判断图像中的目标属于哪个类别。 定位问题:确定目标在图像中的具体位置。 大小问题:目标可能具有不同的大小。 形状问题:目标可能具有不同的形状。 三、算法分类 基于深度学习的目标检测算法主要分为两大类: Two-stage算法:先进行区域生成(Region Proposal),生成有可能包含待检物体的预选框(Region Proposal),再通过卷积神经网络进行样本分类。常见的Two-stage算法包括R-CNN、Fast R-CNN、Faster R-CNN等。 One-stage算法:不用生成区域提议,直接在网络中提取特征来预测物体分类和位置。常见的One-stage算法包括YOLO系列(YOLOv1、YOLOv2、YOLOv3、YOLOv4、YOLOv5等)、SSD和RetinaNet等。 四、算法原理 以YOLO系列为例,YOLO将目标检测视为回归问题,将输入图像一次性划分为多个区域,直接在输出层预测边界框和类别概率。YOLO采用卷积网络来提取特征,使用全连接层来得到预测值。其网络结构通常包含多个卷积层和全连接层,通过卷积层提取图像特征,通过全连接层输出预测结果。 五、应用领域 目标检测技术已经广泛应用于各个领域,为人们的生活带来了极大的便利。以下是一些主要的应用领域: 安全监控:在商场、银行
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