R语言MCMC的lme4二元对数Logistic逻辑回归混合效应模型分析吸烟、喝酒和赌博影响数据

最近我们被客户要求撰写关于混合效应模型的研究报告，包括一些图形和统计输出。

吸烟、喝酒和赌博被认为是由许多因素造成的。Logistic回归分析是一个非常有效的模型，可以检验各种解释变量和二元反应变量之间的关系。同时，双变量模型分析也被用于检验单变量模型之间的相关性。本项目的目的是利用统计方法来检验某个因素是否对吸烟、喝酒或赌博偏好有显著影响。然后用这个结果来预测这些习惯之间的组合。

绪论 

本章介绍了 "解释吸烟喝酒和赌博的参与 "的研究背景。实际上，由于吸烟、喝酒和赌博的双重性和复杂性，它们的争论从未停止。大量的人把吸烟、喝酒和赌博当作坏习惯，有许多原因使他们反对这些习惯，许多研究也支持他们的观点。

文献回顾

涉及吸烟、饮酒和赌博习惯的关联的文献越来越多。在早期的研究中，许多研究者认为，吸烟、喝酒和赌博有明显的结合。每天吸烟的人比非每天吸烟的人更有可能参与赌博活动。每日吸烟者比非每日吸烟者在赌博上花费更多的时间和金钱（Nancy M. Petry和Cheryl Oncken，2002）。

方法论

模型假设

从数据集来看，吸烟、喝酒和赌博的反应显然只有是或不是，这是二进制的。而且，所有的解释因素都可以被归类或被视为连续的。因此，使用Logistic回归作为基本模型是可靠的。

基础知识。Logistic回归可以是二元的，也可以是多元的。在二进制中，结果只能是0或1，而在多进制中，结果可以是三个或更多，例如，A、B和C三个级别。

Logistic函数是

然后

 

如果有多个解释变量，上述表达式β0+β1x可以修改为β0+β1x1+β2x2+...。+ βmxm。在这种情况下，我们假设：Y1=吸烟，Y2=喝酒，Y3=赌博。我们有8个解释者，每个解释者可以分为几个类别。因此

和

其中i = 1, 2, 3

那么，如果吸烟，y1=1，否则y1=0。

y2 = 1，如果喝酒，y2 = 0，否则。

y3=1，如果赌博，y3=0，否则。 

 此外，随机效应也应该被添加到模型中。

带随机效应的Logistic回归

分析数据

以下显示了我们如何进行这项研究。首先，我们参考文献和以前所做的研究，以确定那些被认为对吸烟、喝酒和赌博有重大影响的潜在变量。

结果

在这一部分中，我们将对单一分类的解释因素进行分析。首先，将使用箱形图来显示连续变量与吸烟、饮酒和赌博等的关联。箱形图将显示连续变量与Yi的关系。同时，条形图将被用来显示分类变量的影响。

吸烟结果

ggplot(smoke_age,aes(as.factor(smoking),age))+
geom_boxplot()+labs(title="Smoking-age",x="smoking",y="age")

从图1可以看出，吸烟者的年龄中位数比非吸烟者小。吸烟者的年龄段在18至87岁之间，而非吸烟者则分布在各个年龄段。该图表明，年轻人更有可能吸烟。年龄对吸烟有明显的影响，年龄的估计值为-0.1017，这意味着吸烟和年龄有负相关。

ggplot(smoke_gender, aes(gender,fill=as.factor(smoking)))+
geom_bar(position = "fill")+
labs(title ="Smoking-gender", x = "gender", y = "smoking")

参照图2，1代表吸烟者，0代表不吸烟者。图中显示，男性吸烟者比女性吸烟者多一点，这意味着性别对吸烟偏好有影响。R输出也给出了同样的结论，P值是显著的，男性的估计值为0.20793，这意味着男性更可能吸烟。

 

图3表明，教育水平对吸烟习惯有显著影响。吸烟的概率按照教育水平的顺序排列。拥有较高教育水平的人吸烟的可能性较小。尽管数据不详，但很明显，拥有学位的人最不可能吸烟，而没有学历的人最可能吸烟。HNC组的吸烟者比EDU-18以下组少。图4右侧的估计值与图中的数据相符。随着教育水平的提高，吸烟者的概率明显下降。吸烟的概率与教育水平呈负相关。

带有随机效应的单变量模型

检查随机效应的显著性

fit.no < −glm(gambler 1, f amily = binomial(logit0))

And check significance using

anova(f it.ID, f it.no)

在'fit.no'中加入随机效应后，AIC从1269.5降低到895.3，P值显示了家庭ID的显著影响。因此，在单变量模型中加入随机效应是合理的。

使用'lme4'拟合单变量模型

在这一节中，吸烟、喝酒和赌博的数据将在单变量模型中被拟合。以下是来自R的结果。

re.smoker=glmer(smoker~male+age+income+whiteO+mixed+asian+chinese+african+other+degresummary(re.smoker)

 表2包含对吸烟偏好有明显影响的变量。可以得出结论：男性、年轻、收入低、无学历、单身、分居或失业的人更有可能成为吸烟者。而女性、年龄较大、收入较高、有学位、学生或退休的人则不太可能成为烟民。饮酒模型也有和吸烟模型一样的问题，所以我们也需要放弃一些列以确保模型能够收敛。

以上是本项目中的单变量模型，每个模型都已经分析过了，接下来我们将使用这些单变量模型来拟合双变量模型。

使用 "MCMCglmm "拟合单变量模型

由于每个单变量模型都是由一系列因素拟合的，为了了解反应是如何相互影响的，我们可能还要考虑到与其他性状可能存在的协方差。 

model.smoker<- MCMCglmm(smoker~male+age+income+whiteO+mixed+asian+chinese+african+arasummary(model.smoker)

表5中的显著变量与表2非常相似，唯一不同的是，被放弃的变量 "edu unknown "和 "employother "在表5中是显著变量。

从表6和表3可以看出，使用'lme4'和'MCMCglmm'的饮酒模型预测了相同的显著效果。

与表7和表4相比，大多数重要的变量是相同的，只有 "失业 "在使用 "lme4 "的赌博模型中不显著。

使用'MCMCglmm'的双变量模型

在本节中，我们将计算出本项目的最终结果，即吸烟、喝酒和赌博习惯之间的关系。

在这里，我们可以计算出吸烟者和饮酒者之间的相关关系，其方差为

相关性=posterior.mode(correlation) = 0.16

正相关表明，在这个双变量模型中，喜欢吸烟的人更可能是饮酒者。

在分析了吸烟者和饮酒者之间的相关性之后，我们现在用双变量的'MCMCglmm'模型来测试吸烟者和赌博者之间的关系船。表9显示了单变量模型的协变量。

启示

通过使用逻辑回归法，我们能够确定导致吸烟、喝酒和赌博的重要因素。在本项目中，似乎对这三种习惯都有影响的重要因素是性别、教育水平和婚姻状况。同时，本研究还给出了每个分类因素的估计值，这可以用来说明某个因素对这些习惯的影响是积极的还是消极的。

吸烟、饮酒和赌博之间的组合是通过双变量模型来检验的。利用这个模型，我们可以得到吸烟模型、饮酒模型和赌博模型之间的固定和随机效应的相关关系。例如，通过正相关关系，我们可以说明喜欢吸烟的人也会喜欢喝酒。

References

Kenneth J.Mukamal. The effects of smoking and drinking on cardiovascular disease and risk factors. Alcohol Research & Health Vol. 29, No. 3, 2006

William J. Blot, Joseph K. McLaughlin, Deborah M. Winn, et al. 吸烟和饮酒与口腔和咽喉癌的关系. 癌症研究》1988；48：3282-3287。

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