EXCEPTION ----MSG: ERROR: Cache directory homo_sapiens_refseq not found

最新推荐文章于 2024-04-20 12:06:02 发布
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本文链接：https://blog.csdn.net/qq_21478261/article/details/131836108
版权
在使用VEP的--cache模式时遇到错误：ERROR: Cache目录homo_sapiens_refseq未找到。经排查，问题源于下载的VEP数据解压后的目录名为homo_sapiens。解决方案是将目录名改为homo_sapiens_refseq以匹配程序预期。
摘要由CSDN通过智能技术生成

使用vep --cache模式时报错：

报错

-------------------- EXCEPTION --------------------

MSG: ERROR: Cache directory /nfs/homo_sapiens_refseq not found

原因排查：

直接下载下来的vep数据解压后文件名称为homo_sapiens，

解决：

将homo_sapiens修改为homo_sapiens_refseq

qq_21478261
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homo_sapiens not found in --offline mode
qq_21478261的博客
05-23 238
vep开启offline模式时，报错MSG: ERROR: Cache directory xxx/homo_sapiens not found。添加refseq参数即可。
vcf2maf
weixin_34112208的博客
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