4DCT 数据读取与显示

最新推荐文章于 2024-04-19 17:30:52 发布
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分类专栏： 医学影像基础
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本文以4D-CT数据集中case1为例，详细介绍了如何在缺乏(hdr)头文件的情况下，利用ANALYSE格式的.img文件进行数据读取。通过获取数据的shape和datatype信息构建dataobj，并借助库的animation模块实现数据的动态显示。

摘要生成于 C知道 ，由 DeepSeek-R1 满血版支持， 前往体验 >

以 4D-CT 数据集中 case1为例，

使用nibabel库进行读取, 注意数据集只有 ANALYSE格式的 .img 文件，没有提供 .hdr 头文件，无法直接读取。根据此issue提供的方法，在官网上找到该数据的shape，datatype等信息，通过构造 dataobj 解决。

并用matplotlib库中的animation模块进行动态显示。

代码如下：

import numpy as np
import matplotlib.animation as animation
import nibabel as nib
# load img
path='/home/xin/Downloads/Case1Pack/Images/case1_T00_s.img'
dataobj = np.memmap(path,dtype=np.int16,mode='r',shape=(
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