R语言 —— 包(package)的下载和使用

本文详细介绍R包的三种安装方式:直接通过CRAN在线安装、下载压缩文件后本地安装及Rstudio工具栏安装;同时讲解如何加载、查看和卸载R包,包括查看默认、已加载和所有已安装的R包。

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一、R包的安装(3种方式)

1 在R中直接输入代码在CRAN上查找安装
install.packages("package name")

多个包可以用c()来列出多个包的名字

install.packages(c("package 1","package 2",···))
2 从CRAN、Bioconductors或其他网站上下载R包的压缩文件后使用命令
install.packages("E:/vegan.rar")  #需要绝对路径
3 Rstudio中在菜单栏Tools-Install Packages中查找安装

Install from下拉菜单可以选择是从CRAN还是本地安装包安装

二、包的管理和使用

1 加载包
library(package name)

require(package name)
2 查看R包

①查看默认加载的R包

getOption("defaultPackages")

②查看已加载的R包

(.packages())

③查看所有已安装的R包

(.packages(all.available = T))

installed.packages()

3、卸载包

卸载需要指定在哪个库中,因此参数加上库名,如".Library"

remove.packages(“package name”,.Library)

R软件的介绍 R是一个开放的统计编程环境,是一种语言,R语言是从S语言演变而来的。S语言是二十世纪70年代诞生于贝尔实验室,由Rick Becker, John Chambers, Allan Wilks开发。基于S语言开发的商业软件Splus,可以方便的编写函数、建立模型,具有良好的扩展性,取得了巨大成功。1995年由新西兰Auckland大学统计系的Robert GentlemanRoss Ihaka,编写了一种能执行S语言的软件,并将该软件的源代码全部公开,这就是R软件,其命令统称为R语言。R是开源软件,代码全部公开,对所有人免费。R可在多种操作系统下运行,如Windows, Li~UNIX等。R需要输入命令,可以编写函数脚本进行批处理运算,语法简单灵活。目前在R网站上约有两千多个程序,涵盖了基础统计学、社会学、经济学、生态学、地理学、医学统计学、生物信息学等诸多方面。 R的获取与安装 R诞生于the University of Auckland的统计系。The Comprehensive R Archive Network简称CRAM,提供下载安装程序相应软件。 R主页http://www.r-project.org/a下载:CRAM,选择镜像(如:http://cran.cnr.berkeley.edu/ ),选择操作系统(Linux,Windows或MacOS)。 以下简述R FOR WINDOWS的安装使用: 在R主页下可以找到R的各个版本的安装程序源代码。点击进入:Windows (95and later),再点击:base,下载SetupR.exe,约18兆,此便是R FOR WINDOWS的安装程序。双击SetupR.exe,按照提示一步步安装即可。 安装完成后,程序会创建R程序组并在桌面上创建R主程序的快捷方式(也可以在安装过程中选择不要创建)。通过快捷方式运行R,便可调出R的主窗口。 类似于许多以编程方式为主要工作方式的软件,R的界面简单而朴素,只有不多的几个菜单快捷按钮。快捷按钮下面的窗口便是命令输入窗口,它也是部分运算结果的输出窗口,有些运算结果则会输出在新建的窗口中。 主窗口上方的一些文字是刚运行R时出现的一些说明指引。 文字下的:>符号便是R的命令提示符,在其后可输出命令;>后的矩形是光标。R一般是采用交互方式工作的,在命令提示符后输入命令,回车后便会输出结果。 在R朴素的界面下,是丰富而复杂的运算功能。 附加安装 install. packages(package name, dependencies=TRUE) Windows下可以用菜单Packages--} Install package(s)安装 版本的更新 主程序:Windows下面只能卸载再安装 程序:update.packages() RStudio R语言可以独立运行,但是Rstudio作为R附加的GUI,有效的划分功能区,使输入输出更为方便。 RStudio是可以在Mac OS X, LinuxWindows上运行在R编程语言中的生产力灵活的用户界面。是一个自由开源编程语言环境,提供了大量的图形统计方法统计计算图形。从中可以快速方便地访问各种生产力工具的面向用户的界面。RStudio是一个非常实用的R语言的IDE,是一个免费的软件,特别是其服务器软件,可以将其构建在Linux服务器上,然后通过远程网页登陆访问,使得R语言使用获得了极大的方便,也可以说是一个小小的云服务。
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