TargetFinder 安装和使用经验-WSL2-ubuntu

@[TOC]TargetFinder 安装和使用经验-WSL2-ubuntu

前言

处理测序数据，想预测一下miRNA的靶基因，先试了一下psRobot，各种尝试没有安装成功，放弃。看到TargetFinder也有类似功能，试了几次成功了，分享给大家。本文参考了wyh0908的文章，链接如下：https://blog.csdn.net/weixin_43960055/article/details/115050755

1.环境

基于win10系统WSL2的ubuntu环境，16G内存戴尔。

2.下载软件

git clone https://github.com/carringtonlab/TargetFinder

TargetFinder的依赖包：
1、perl version5.8以上
2、fasta35
从github下载fasta36:git clone https://github.com/wrpearson/fasta36
如果下载不了，从如下网站手动下载：
https://fasta.bioch.virginia.edu/wrpearson/fasta/CURRENT/
或者https://fasta.bioch.virginia.edu/fasta_www2/fasta_down.shtml
有linux版本和win32版本，我用WSL2,所以安装了win32版本，按照readme到src中make一下即可，反正能用。

3.安装-试运行

运行TargetFinder出现大量报错，但报错原因基本是一个：
Can’t locate