TargetFinder安装和运行问题的解决

TargetFinder常用的基于植物的靶标罚分策略预测小RNA的靶标软件

TargetFinder的依赖包：
1、perl version5.8以上；
2、fasta35。

一、TargetFinder的安装

$ git clone https://github.com/carringtonlab/TargetFinder

需要翻墙，一般国内网不能正常访问github。

二、运行TargetFinder出现第一错：

Can't locate File/Which.pm in @INC 

解决方法：

(1) 使用cpan安装Which.pm

> perl -MCPAN -e shell
cpan[1]> install File::Which
cpan[2]> q

如下是运行过程的显示的部分信息：

# PERL5LIB path
# /home/Biochem/.cpan/build/File-Which-1.24-0/blib/lib
# /home/Biochem/.cpan/build/File-Which-1.24-0/blib/arch
# /home/Biochem/.cpan/build/BioPerl-1.7.8-0/lib/Bio
# /home/Biochem/.cpan/build/BioPerl-1.7.8-0/lib/Bio

Installing /home/Biochem/anaconda3/lib/site_perl/5.26.2/File/Which.pm
Installing /home/Biochem/anaconda3/man/man3/File::Which.3

(2) 配置@