简介
Rdkit 是干个什么呢,RDkit 是一款开源化学信息学与机器学习工具包,提供C++ 和python 的API 接口。是著名的开源化学信息学工具之一,基于BSD协议,核心数据结构与算法由C++编写。支持Python2与python3,支持KNIME,支持机器学习方面的分子描述符的产生。
环境
macOS
Python 3.7
安装
1.Conda模式 官方建议使用Conda进行安装与管理,Conda可以使用清华的源进行下载,安装完成后,再次更换其安装源。换源的命令参考
conda create -c rdkit -n my-rdkit-env rdkit
激活的方法:
conda activate my-rdkit-env
退出环境
conda deactivate
2.Pycharm模式 Pycharm并不能直接安装RDkit,当使用上一步Conda安装完成后,将python的环境配置修改为conda的目录,即可在pycharm中使用Rdkit。
运行代码
导入库