macOS 如何安装Rdkit

本文介绍了如何在macOS环境下安装RDKit,一个开源的化学信息学与机器学习工具包。提供了通过Conda和PyCharm两种方式进行安装,并展示了如何在Python环境中导入并使用RDKit库来展示分子结构。
摘要由CSDN通过智能技术生成

简介

Rdkit 是干个什么呢,RDkit 是一款开源化学信息学与机器学习工具包,提供C++ 和python 的API 接口。是著名的开源化学信息学工具之一,基于BSD协议,核心数据结构与算法由C++编写。支持Python2与python3,支持KNIME,支持机器学习方面的分子描述符的产生。

文档:[https://www.rdkit.org/]

环境

macOS
Python 3.7

安装

1.Conda模式 官方建议使用Conda进行安装与管理,Conda可以使用清华的源进行下载,安装完成后,再次更换其安装源。换源的命令参考

conda create -c rdkit -n my-rdkit-env rdkit

激活的方法:

conda activate my-rdkit-env

退出环境

conda deactivate

2.Pycharm模式 Pycharm并不能直接安装RDkit,当使用上一步Conda安装完成后,将python的环境配置修改为conda的目录,即可在pycharm中使用Rdkit。

运行代码

导入库


                
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