Linux中运行sh命令出现/usr/bin/env: ‘bash\r’: No such file or directory解决方式及使用moltemplate遇到的坑

目的：使用moltemplate这个软件来生成lammps需要的data等文件

遇到的问题及解决方式

步骤：

一、下载moltemplate安装包
1.官网下载：http://www.moltemplate.org/
2.git下载：选择一个文件下下右键git bash（前提是安装了git），
git clonehttps://github.com/jewettaij/moltemplate.git

二、python安装相关包（前提是已经安装python）推荐python3以上版本
cmd切换到该文件夹，使用pip安装

pip install . --user

出现了以下错误：

解决办法：
1.找到相关版本python的目录下的python.exe将python3.exe改成python.exe
2.如果安装python比较多可以在环境变量中删除出错的python的环境变量

下载完成后添加环境变量：

三、在http://www.moltemplate.org/examples.html示例中下载相关的lt文件并放在一个文件夹中，cmd进入该文件夹，运行命令moltemplate.sh system.lt，但是会出现一闪而过没有结果，且文件夹中没有data文件且其它相关文件的出现。查询相关资料后发现需要使用Linux系统。
相关文档在如下图示中有介绍：

参考文献链接如下：
Moltemplate: A Tool for Coarse-Grained Modeling of Complex Biological Matter and Soft Condensed Matter Physics
doi：https://doi.org/10.1016/j.jmb.2021.166841
四、安装Linux
我采用的是windows商店里的windows子系统unbuntu20.04
下载完成之后进入windows文件中

cd /mnt/e #进入windows下的e盘
cd moltemplates_test #进入包括示例lt文件的文件夹

运行命令：moltemplate.sh system.lt
但是依然报如下错误：

经查阅资料发现是由于windows格式的shell多了个\r ，在linux中识别的方式不一样，这主要是因为bash后面多了\r这个字符的原因。在linux终端下，输出\r会什么都不显示，只是把光标移到行首。于是终端虽然输出了/usr/bin/env bash，但是碰到\r后，光标会被移到行首，接着输出了:No such file or directory把前面的覆盖掉了。可以参考：
https://stackoverflow.com/questions/29045140/env-bash-r-no-such-file-or-directory
解决办法：
1.使用vim进入moltemplate.sh文件中

vim moltemplate.sh

2.键盘输入：set ff然后回车，：set ff=unix 然后保存退出，：wq！回车，问题解决。
重新输入sh命令后：

打开moltemplate_test文件：

已经成功生成data及in文件。