选择列
df=pd.DataFrame(np.random.rand(3,11),columns=list(‘ABCDEFGHIJK’))
df
#1
pd.concat([df.loc[:‘A’,‘C’],df.loc[:,‘F’],df.loc[:,‘J’:‘K’]],axis=‘columns’)
#2
df[list(df.columns[0:3])+list(df.columns[5])+list(df.columns[9:11])]
#3
df.iloc[:np.r[0:3,5,9:11]]
从 PDF 表格中提取表格数据时比较困难的。不久前,一位开发者提供了一个名为 Camelot 的工具,满足大家从 PDF 文件中提取表格数据。
不会编程如何生信分析(1)差异分析
新建一列group1_mean,其计算式为 =AVERAGE(B2:Z2) 。其中B到Z列为组1的样本。同样的道理,新建一列group2_mean,其计算式为 =AVERAGE(AB2:AZ2) ,其中AB到AZ列为组2的样本。
(3)计算foldchange和LogFC
新建一列foldchange,为group1_mean除以group2_mean。新建一列LogFC,其表达式为 =log(foldchange, 2);
=LOG(BC2,2)
4)计算P值
新建一列P.value,其计算式为 =T.TEST(B2:Z2, AB2:AZ2)