Python生信练习——hg38每条染色体基因,转录本的分布

#读取文件
fr = open('Homo_sapiens.GRCh38.87.chr.gtf','r')
#输出到文件166out
fw = open('166out','w')
n = 0
for line in fr:
    if line.startswith("#"):
        m = 0
    else:
        line = line.strip().split('\t')
        if line[0] == n or line[0] == '1':
            n = line[0]
            if line[2] == 'transcript':
              m += 1
        else:
            print(n,file=fw)
            print(m,file=fw)
            m = 0
            n = line[0]
            m = 1

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