生信分析用python还是r_生信分析中常用的R语句

本文介绍了使用R语言进行生物信息学分析的一些常见代码和操作,包括设置工作路径、读写文件、数据筛选、取消科学计数法、合并数据以及统计分析等,帮助读者理解和应用R语言在生信分析中的技巧。
摘要由CSDN通过智能技术生成

一、前言

好难受,今天的R崩了、昨天才安装的包怎么报错了、为啥我装了这个包没反应,什么鬼怎么又乱码了。这玩泥巴(╯‵□′)╯︵┻━┻

不行要佛系生活,好久没写简书了,还是来整理下代码吧┬—┬ノ('-'ノ)

二、常见的生信分析代码整理

今天要说的事如题,这些都是本人完成的流程中非常常见的R代码,以下一一整理并为其注释,没事就经常翻阅这些代码瞧瞧。

不过话说回来,R真的好垃圾啊(/‵Д′)/~ ╧╧

老板来了,我永远喜欢R语言┬─┬ ノ( ' - 'ノ)

1.系统读写相关

设置工作路径

设置工作路径,大家习惯打开R程序,而不是在固定的位置打开R,那么很有可能你就要设置工作路径,这样做的目的是为了节省语句。注意一下,这是/左斜杠,windows下复制路径是\斜杠,新人老容易犯这个错误

setwd("D:/R")

读取文件

读取txt文件,./为当前路径,与OS文件读取方法类似,参数sep = "\t"为以TAB制表符区分行列,comment.char = "#"为#号为注释内容,stringsAsFactors = F 为取消字符串转换为因子,header = T为有表头,fill=TRUE 如果为true,则在行长度不相等的情况下,将隐式添加空白字段。./是指当前目录下的Human_ppi_symbol_2019_7.txt文件,当然也可以写绝对路径。

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