canu安装（无root权限不联网不配置环境变量）

最新推荐文章于 2024-04-15 09:38:02 发布

不想翻身的小咸鱼

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分类专栏：软件编译安装文章标签： linux

本文链接：https://blog.csdn.net/qq_39876968/article/details/116010727

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本文介绍了如何在没有root权限且不联网的情况下，通过源码编译安装Canu 1.8和gnuplot 5.2.8。Canu是用于高噪声单分子测序数据组装的工具，适合PacBio RSII和Oxford Nanopore MinION数据。文章详细阐述了安装过程，包括每个步骤和安装成功标志。

摘要由CSDN通过智能技术生成

简介

Canu是Celera Assembler的一个分支，专门用于高噪声单分子测序（例如PacBio RSII或Oxford Nanopore MinION）。Canu将来自PacBio RS II或Oxford Oxford Nanopore MinION仪器的读数组装成独特可组装的重叠群单位。Canu将许多设计和代码归功于celera-assembler。
Canu可以使用几乎任何形状或大小的硬件运行，从笔记本电脑到具有数千个节点的计算网格。显然，较大的程序集将需要很长时间在笔记本电脑上进行计算，而较小的程序集无法利用数百个节点，因此，在确定可以有效使用哪些硬件方面，正在组装的内容起了一定的作用。
canu中的大多数算法都是多线程的（以使用单个节点上的所有内核），并行化的（以使用网格中的所有节点）或两者（所有节点上的所有内核）。