【论文研读】【医学图像分割】【BCRNN】Fine-grained Recurrent Neural Networks for Automatic Prostate Segmentation ...

【论文研读】【医学图像分割】【BCRNN】Fine-grained Recurrent Neural Networks for Automatic Prostate Segmentation inUltrasound Images

本文仅仅为个人快速阅读记录。推荐另一篇博客《精细递归神经网络在超声图像前列腺自动分割中的应用(读后感)》
Yang X , Yu L , Wu L , et al. Fine-grained Recurrent Neural Networks for Automatic Prostate Segmentation in Ultrasound Images[J]. 2016.

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RNN


Abstract

超声图像中的前列腺自动分割。

  • 将边界转化为动态序列数据利用RNN进行处理。
  • 提出多视角融合策略。
  • 植入Auto-Context方案中。

Introduction

前列腺超声图像边界不完整。绿色、黄色和蓝色箭头分别表示边界不足、边界模糊和异质性严重。红色曲线表示分割的ground truth。

Methodology

解决方案总体框架如下图:

"多视角"下的多组数据送入本文提出的BCRNN,然后democratically merge 得到预测值,然后和原图整合再进行一轮…,三轮后得到最终结果。

Shape Inference with BCRNN

将超声图像由笛卡尔坐标系转换为图像中心周围的极坐标系统,生成序列化。如下图所示。

使用了双向LSTM,其中输入输出细节如下。

前后向lstm模块的输出结合进行预测。

Multiple Viewpoint Fusion

作者发现从不同的起始点序列化静态超声图像会导致形状预测略有不同,并将这种现象解释为,从不同的起始点进行序列化,可能会改变上下文相关的序列元素之间的相对距离,从而导致预测略有差异。

如图,第一种序列化方式保留了这三个片段之间的相对空间关系,而第二种方式破坏了片段间的连续性。由此便提出的"多视角融合"(选择从三个不同的角度对原始静态超声图像进行串行化)。

Multiscale Auto-Context for Refinement

Experimental Results

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