学习笔记——材料计算

VASPKIT

VASPKIT 是一个为 VASP 代码从原始计算数据中对各种材料属性进行高通量分析的界面。该程序可以在交互式用户界面或命令行模式下方便地运行。

VASPKIT介绍

关于 VASPKIT 的运行界面如下：

VASPKIT安装

安装准备：

1. VASPKIT安装：https://sourceforge.net/projects/vaspkit/files/Binaries/
   
   【这里咱们下载最新版本】

2. Anaconda安装：https://www.anaconda.com/
   
   【这里咱们下载Linux版本】
   简单解释一下，为什么安装VASPKIT还需要Anaconda呢？
   答：可以从官网这里看到答案哈。
   
   翻译一下就是安装 VASPKIT 之前需要安装以上的4个依赖项，最好呢就是安装Anaconda来管理各种 python 包。

安装步骤：

1. 将下载下来的文件上传至服务器中的指定文件夹中【自己创建新的文件夹】
   

2. 安装Anaconda：
   （1）在终端中，用cd命令进入Anaconda文件夹，输入sh ./Anaconda3-2023.07-0-Linux-x86_64.sh，注意斜杠后面的是你下载版本的文件名，直接复制即可。
   （2）系统中出现Please, press ENTER to continue，跟随指示，一直摁ENTER，疯狂摁
   （3）系统中出现Do you accept the license terms? [yes | no]，咱们首当其冲，当然是输入yes
   
   （4）系统中出现如下显示时，便是要输入文件名啦，这里咱们可以输入Anaconda作为文件名
   
   （5）经历漫长的等待……LOADING……等到进度条到100%
   
   （6）进度条到100%后，会继续慢慢加载，直至出现Do you wish the installer to initialize Anaconda3 by running conda init?，咱们毫不犹豫，输入yes
   
   （7）接着还是等待，当你看到Thank you for installing Anaconda3!的时候说明Anaconda已经安装成功了
   

3. 安装VASPKIT：
   （1）在终端中，用tar -zxvf vaspkit.1.4.1.linux.x64.tar.gz命令首先对下载的文件进行解压，注意命令后面的是你下载版本的文件名，直接复制即可。
   （2）在等待一段时间后，终端中输入ls命令，可以看到解压成功的文件夹。
   
   （3）修改.vaspkit文件，输入vi ~/.vaspkit命令后，找到PBE_PATH和PYTHON_BIN这两行，将后面的路径改成自己服务器中对应文件的路径，可以用pwd命令找到路径。注意 PYTHON_BIN后面路径中的/python3得保留，不要删除。
   例如：PBE_PATH——/home/users/software/PAW_PBE
   PYTHON_BIN——/home/users/software/Anaconda/bin/python3
   【文章内添加了本人自用赝势文件，需要的可以下载】
   
   （4）修改完成后，按一次Esc键，随后输入:wq，代表保存并退出，即可。
   （5）在终端中，输入cd vaspkit.1.4.1后进入目录，接着继续输入bash setup.sh，出现如下图所示，跟随指令输入source ~/.bashrc。
   
   （6）完成以上操作后，在终端中输入vaspkit，出现以下界面，则代表VASPKIT安装成功。
   

VASP输入文件

POSCAR

优化前体系的结构信息，包括晶轴矢量、原子坐标——初始结构的位置

POTCAR

各元素对应的赝势函数——描述原子的物理性质

KPOINTS

布里渊区积分的K点网格（取的点越密，计算精度越高，耗时越长）

INCAR

程序运行的主要参数，包括计算采用的函数、离子位置优化方法等
生成方式：VASPKIT----->1----->101