R语言之分组做正态性检验及批量t检验

最新推荐文章于 2024-03-28 13:57:06 发布
最新推荐文章于 2024-03-28 13:57:06 发布
阅读量1.2w 收藏 43
点赞数 6
分类专栏： R语言
版权声明：本文为博主原创文章，遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议，转载请附上原文出处链接和本声明。
本文链接：https://blog.csdn.net/qq_42458954/article/details/82852554
版权

1.分组做正态性检验

使用tapply()函数

如data为变量值，group为分组变量，则可以写为：

tapply(data,group,shapiro.test)

2.批量t检验

pvalue=apply(data,1,function(x) t.test(x[1:3],x[4:6],paired = T)$p.value)

3.批量设置为因子

Arabidopsis[,c("gen","rack","nutrient")] <- lapply(Arabidopsis[,c("gen","rack","nutrient")], factor)


 

一个人旅行*-*
关注
  • 6
    点赞
  • 踩
  • 43
    收藏
    觉得还不错? 一键收藏
  • 4
    评论
专栏目录
R多变量正态性检验（Multivariate Normality Tests）
data+scenario+science+insight
07-21 1732
R多变量正态性检验（Multivariate Normality Tests） 目录 R多变量正态性检验（Multivariate Normality Tests） Mardia’s 检验 能量energy检验 当我们想测试单个变量是否正态分布时，我们可以创建一个Q-Q图来可视化分布，或者我们可以执行一个正式的统计检验，如Anderson Darling检验或Jarque-Bera检验。 然而，当我们想要检验几个变量是否符合多元正太分布的时候，我们必须执行多元正态性检..
R语言中5种正态性检验的方法
Mrrunsen的博客
02-09 2万+
统计学中的t检验和方差分析等方法的应用条件是样本都来自正态总体或近似正态总体，只有符合这个条件，才能用这些方法来检验各样本所属的总体参数的差异显著性。文本向大家介绍在R语言中检验正态性的几种方法： 1、Kolmogorov-Smirnov检验 K-S检验检验单一样本是否来自某一特定分布。比如检验一组数据是否为正态分布。它的检验方法是以样本数据的累积频数分布与特定理论分布比较，若两者间的差距很小，则推论该样本取自某特定分布族。K-S检验的原假设和备择假设为： H0:样本所来自的总体分布服从
写R脚本：以对多分组数据进行正态分布检验为例
yanlingbin的专栏
07-24 8720
问题提出 正态分布检验一次只能检验一个分组，如果有多组数据需要检验，则需要运行多次 解决思路 使用循环命令可以实现按一定规则计算。 如果以后也经常需要使用，写成脚本调用更方便些，需要使用的时候直接调用即可。 脚本针对的场景相对直接使用循环命令更广泛写，如果仅使用循环命令，很多参数与类型定义直接使用数据对应的即可，因此写脚本难度相对高一些，但是设计出可以通用的脚本也是小小的成就。 ...
R语言——批量t检验，作箱型图并进行显著性标记
MSb_007的博客
08-31 1028
为了能够将显著性标记换成P值，并以合适的计数方法输出，运用了t.test()函数。同时，运用一个自定义函数（根据数字的大小选择是否使用科学计数法），感觉应该有更简洁的实现方式，还需要继续学习鸭吼吼吼吼。上面的代码，有参考chatgpt给的答案，真是好玩啊哈哈哈哈！只要将代码和报错信息复制黏贴，就会给出修改建议！当然也可以让它逐行解释代码，帮忙写代码。书接上回：为了满足要求，需要对数据进行t.test，并标注到图上。只能说chatgpt真是厉害，可以帮忙写代码。
正态性检验R语言实现及其案例
最新发布
06-04
正态性检验是统计判决中重要的一种特殊的拟合优度假设检验，其目的是利用观测数据判断总体是否服从正态分布。 一、定义 正态性检验是判断样本数据是否符合正态分布的一种统计方法。如果一组观测值来自正态总体，具有...
在python中做正态性检验示例
09-18
今天小编就为大家分享一篇在python中做正态性检验示例，具有很的参考价值，希望对大家有所帮助。一起跟随小编过来看看吧
ISLR_1.0.zip_R语言做检验_r语言islr_t检验
09-24
本主题主要关注R语言中的t检验、符号检验以及威尔森检验，这些都是在进行假设检验时常用的方法。下面将详细阐述这些检验的原理和在R中的实现。 首先，t检验是用于比较两个样本均值是否显著不同的统计方法。在R中，...
Python数据正态性检验实现过程
09-17
K-S检验是一种更通用的分布拟合检验，不仅可以检验正态分布，还可以用于其他分布。在Python中，使用`scipy.stats.kstest`函数执行K-S检验。该函数的参数包括观测数据`rvs`、期望的累积分布函数`cdf`以及其它可选...
SPSS软件正态性检验ppt课件.ppt
11-13
"SPSS软件正态性检验ppt课件" 本资源为SPSS软件正态性检验ppt课件，主要介绍了SPSS统计分析的基本概念和方法，包括单个名义变量统计描述、多指标统计描述、P-P图法、Q-Q图法、直方图、箱式图与茎叶图法等。通过实例...
在使用R语言环境中如何进行正态性检验的保姆级教程
Mrrunsen的博客
02-17 502
在这个例子中，我们使用了airway数据集中的gene列作为基因表达值，然后执行了Shapiro-Wilk正态性检验，查看基因表达值是否满足正态分布。在使用Shapiro-Wilk检验时，如果p-value小于设定的显著性水平（通常为0.05），我们会拒绝原假设，即认为数据不是来自正态分布。在正态性检验中，我们会使用Kolmogorov-Smirnov检验来比较样本的累积分布函数（CDF）与理论正态分布的CDF之间的差异。因此，对生物学数据进行正态性检验是必要的，以确保所应用的统计方法的准确性和可靠性。
R语言t检验
zsc943290710的博客
03-25 2万+
一、概念 t检验又称Student's t检验，是以t分布为基础的统计分析方法。是定量资料分析中最为常见的假设检验方法。 二、应用条件 1、在单样本t检验中，总体标准差σ未知且样本含量较小（n<50）时，要求样本来自正态分布总体； 2、两个小样本均数比较时，要求两个样本均来自正态分布总体，且两样本总体方差相等； 如果两个样本方差不等，则用t'检验； 3、对于两个大样本（样本数均大于50）的均数比较； 在实际应用当中，与上述条件稍有偏差，只有数据呈单峰分布，且近似对称分布，一般影响不大。
R语言批量计算t检验，输出pvalue和均值
weixin_44231554的博客
03-28 813
R语言批量计算t检验，输出pvalue和均值
ggplot2学习笔记-修改坐标轴刻度
热门推荐
Christina
07-22 11万+
1.修改坐标轴显示范围 scale_x_continous(limits=c("A","B")#显示范围为A-B 或者ylim(A,B) 2.修改坐标轴显示刻度 scale_x_continous(limits=c("A","B"), breaks=seq(起始值，终止值，间隔)) 3.修改坐标轴标签 旋转坐标轴标签theme(axis.text.x=element_text(angl...
广义相加模型（GAM）及R实现
Christina
03-25 6万+
当解释变量与效应变量间关系不明确时，通常可以使用广义相加模型来检测比变量间是否具有非线性关系。 广义相加模型通过光滑样条函数、核函数或者局部回归光滑函数，对变量进行拟合。GAM采用模型中的每个预测变量并将其分成多个部分（由'结'​​分隔），然后将多项式函数分别拟合到每个部分。GAM的原理是最小化残差（拟合优度）同时最大化简约性（最低可能自由度）。回归模型中部分或全部的自变量采用平滑函数，降低线...
R语言subset函数
Christina
07-24 5万+
1.subset函数，从某一个数据框中选择出符合某条件的数据或是相关的列 1）单条件查询 df&lt;-data.frame(Age=c(22,24,25,26),Gender=c("Girl","Girl","Boy","Boy"),City=c("Shanghai","Beijing","Guangzhou","Nanjing"))
用R进行meta分析（metafor包）
Christina
07-26 5万+
这里以我的一篇meta分析为例，详细描述meta分析的一般步骤，该例子实现的是效应量β的合并 R包:metafor或meta包，第一个例子以metafor包为例 1.准备数据集 2.异质性检验 install.packages("metafor") library(metafor) metamod&lt;-rma(yi=β,data=metabirth3,sei=se,method=...
中介效应分析及R实现
Christina
01-23 5万+
1.中介效应的定义 如果自变量X通过某一变量M对因变量Y产生一定影响，则称M为X和Y的中介变量。研究中介作用的目的是在已知X和Y关系的基础上，探索产生这个关系的内部作用机制。作用关系图如下： X对Y的总效应分为直接效应（direct effect）和间接效应(indirect effect)，直接效应是指当中介变量（M）固定在某一水平时，自变量X对结局变量Y的效应。间接效应是指自变量X通过...
RData的保存与加载
Christina
11-09 4万+
9.5.RData files The best way to store objects from R is with.RData files..RDatafiles are specific to R and can store as many objects as you’d like within a single file. Think about that. If you are conducting an analysis with 10 different dataframes a...
R语言单因素方差分析分组进行正态性检验、齐次性检验代码
05-10
进行单因素方差分析前，需要进行正态性检验和齐次性检验。下面是一些R语言的代码示例： 假设有一个名为“data”的数据框，其中包含了一个名为“group”的因子变量和一个名为“outcome”的数值型变量。我们想要进行单因素方差分析并进行正态性检验和齐次性检验。 正态性检验： ```R # Shapiro-Wilk正态性检验 shapiro.test(data$outcome) # Anderson-Darling正态性检验 library(nortest) ad.test(data$outcome) # QQ图 qqnorm(data$outcome) qqline(data$outcome) ``` 齐次性检验： ```R # Bartlett's test bartlett.test(data$outcome, data$group) # Levene's test library(car) leveneTest(data$outcome, data$group) ``` 这些代码将分别执行Shapiro-Wilk正态性检验、Anderson-Darling正态性检验、QQ图、Bartlett's检验和Levene's检验。根据你的数据和研究问题，你可以选择其中的一个或多个方法来检验正态性和齐次性。

“相关推荐”对你有帮助么？

  • 非常没帮助
  • 没帮助
  • 一般
  • 有帮助
  • 非常有帮助
提交
评论 4
添加红包

请填写红包祝福语或标题

个

红包个数最小为10个

元

红包金额最低5元

当前余额3.43元 前往充值 >
需支付：10.00元
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付元
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明：

1.余额是钱包充值的虚拟货币，按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载，可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值