生信
文章平均质量分 72
生信小白学习笔记
谙隅
这个作者很懒,什么都没留下…
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RNA-seq数据分析——质量控制和预处理的软件
质量问题通常来源于测序本身或前面的文库制备。它们包括可信度低的碱基、序列特异性差的偏差、3’/5’位置偏差、聚合酶链反应(PCR)假象、未修剪的接头,以及序列污染。这些问题可能严重影响参考作图、组装及表达的估计,但这些问题很多可以通过过滤、修剪、纠错或偏差订正被矫正。有些问题不能被纠正,但在解释结果时至少应该意识到它们。读段的质量检查工具包括 FastQC 和 PRINSEQ,它们检查若干个质量指标,并提供可视化的报告。PRINSEQ软件包还提供过滤和修剪功能。FastQCFastQC可以原创 2022-05-02 15:51:57 · 1187 阅读 · 0 评论 -
【学习笔记】R数据科学(R for Data Science)—第3章 使用dplyr进行数据转换
【学习笔记】R数据科学(R for Data Science)—第3章 使用dplyr进行数据转换原创 2021-08-17 22:18:26 · 9893 阅读 · 3 评论 -
【学习笔记】R数据科学(R for Data Science)—第2章 工作流:基础
【学习笔记】R数据科学(R for Data Science)—第2章 工作流:基础练习题原创 2021-08-17 00:45:19 · 722 阅读 · 0 评论 -
【学习笔记】R数据科学(R for Data Science)—第1章 使用ggplot2进行数据可视化
【学习笔记】R数据科学(R for Data Science)—第1章使用ggplot2进行数据可视化原创 2021-08-17 00:36:57 · 5405 阅读 · 0 评论 -
GO基本知识
GO的全称是Gene Ontology,中文意思是基因本体论。GO是一个国际标准化的基因功能分类体系,提供了一套动态并可控的词汇表来全面描述生物体中基因和基因产物的属性,它由一组预先定义好的GO术语(GO term)组成,这组术语对基因产物的功能进行限定和描述。GO terms是对基因的产物而不是基因本身进行描述,因为基因的产物有时候不止一种。GO知识库GO terms提供生物过程的逻辑...原创 2020-06-13 11:21:57 · 14982 阅读 · 0 评论 -
生物学软件大汇总!史上最全
基因芯片1、基因芯片综合分析软件。ArrayVision 7.0 一种功能强大的商业版基因芯片分析软件,不仅可以进行图像分析,还可以进行数据处理,方便protocol的管理功能强大,商业版正式版:6900美元。Arraypro 4.0 Media Cybernetics公司的产品,该公司的gelpro, imagepro一直以精确成为同类产品中的佼佼者,相信arraypro也不会差。pho...转载 2019-09-30 18:21:51 · 15109 阅读 · 0 评论 -
生信相关网站
http://www.xiaolvji.com/u/bioinfoclub?tdsourcetag=s_pcqq_aiomsg网页来自https://www.jianshu.com/p/7a8da453c9e6原创 2019-08-23 16:39:16 · 419 阅读 · 0 评论 -
Rstudio安装R包错误
**R包安装错误: 无法打开 URL’https://cran.rstudio.com/src/contrib/PACKAGES’解决办法:win10:控制面板>internet选项>高级>安全,勾选使用TLS.1.1和使用TLS1.2原创 2020-05-19 14:15:57 · 2580 阅读 · 0 评论