PICRUST2注释

PICRUST2结果文件注释
需要进入picrust2-2.4.2目录

根据官方网站,添加注释的代码如下:
官方网站链接:PICRUST2 wiki

add_descriptions.py -i EC_metagenome_out/pred_metagenome_unstrat.tsv.gz -m EC \
                    -o EC_metagenome_out/pred_metagenome_unstrat_descrip.tsv.gz

add_descriptions.py -i KO_metagenome_out/pred_metagenome_unstrat.tsv.gz -m KO \
                    -o KO_metagenome_out/pred_metagenome_unstrat_descrip.tsv.gz

add_descriptions.py -i pathways_out/path_abun_unstrat.tsv.gz -m METACYC \
                    -o pathways_out/path_abun_unstrat_descrip.tsv.gz

注释前PICRUST2结果文件,可以通过Linux系统获得,或者利用Galaxy平台。

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