【R语言】一文解决R语言包安装不上问题（尤其是devtools）

小丫么小阿豪

已于 2022-05-25 10:36:38 修改

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分类专栏： R语言文章标签： r语言

于 2022-05-25 10:35:56 首次发布

本文链接：https://blog.csdn.net/qq_43426078/article/details/124961030

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Motivation

真的要被R语言的环境配置折腾死了…用的conda管理，下载R包的时候一堆错误爆出来人都整麻了。看了下网上也没什么很好的教程，自己动手写一个吧。

首先，推荐大家用anaconda管理R环境。（废话，网上都这么说）。重点来了，安装完conda一定要设置bioconda的通道，不然很多包找不到。（这部分是网上抄袭重灾区，都是直接复制黏贴别人的）。

安装anaconda/miniconda。这部分不在本文体现了，需要的朋友自行百度，教程很多。本人用的是anaconda（miniconda是个精简版的anaconda）。
设定bioconda、conda-forge通道。
为什么要做这一步呢？因为conda的包会从channel里搜索，默认情况下如果大家不添加bioconda和conda-forge通道，很多生信的包是根本找不到的。
```
conda config --add channels defaults
conda config --add channels bioconda
conda config --add channels conda-forge
```
配置R语言环境。
推荐用以下命令创建一个新的R环境，意思是创建一个环境并安装r-base r-essentials r-irkernel。
```
conda create -n R r-base=4.1 r-essentials r-irkernel
```
如果大家已经有环境了，可以直接用这个命令：
```
conda install r-base=4.1 r-essentials r-irkernel
```
安装jupyter。
```
conda install jupyter
```
大功告成
之后要安装R包，建议直接用conda装。
例如，要安装devtools，可以用如下命令：
```
conda install r-devtools
```