团簇生长过程-Ovito渲染

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已于 2023-03-05 10:54:12 修改

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分类专栏： Ovito渲染案例教程集文章标签： Lammps Ovito 团簇渲染

于 2022-12-31 16:59:34 首次发布

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文章目录

一、选择出团簇原子和非团簇原子
- 1. 选择团簇原子
- 2. 删除非团簇原子
二、选择出团簇原子和非团簇原子
- 1. 团簇分析
- 2. 团簇具体信息
三、渲染团簇
- 1、对团簇进行选择
- 2、获得团簇渲染后的结果
四、渲染结果
五、案例dump下载

博文《根据近邻列表法识别团簇—冷凝成核 Matlab+Ovito（上）》中给出了如何识别团簇的代码，这里不再赘述，只讨论渲染过程。

$本案例突出团簇的形成、生长过程。$

一、选择出团簇原子和非团簇原子

1. 选择团簇原子

这里通过程序识别后的 $\rm Dump$ 轨迹进行的筛选。选出后，暂时删除这些原子。

请添加图片描述

2. 删除非团簇原子

请添加图片描述

二、选择出团簇原子和非团簇原子

1. 团簇分析

筛选出团簇原子，并采用 $O v t i o$ 自带的团簇分析功能， $\rm Cluster\ analysis$ 。

请添加图片描述

可以看到Ovito可以很好识别出来体系内的团簇。
请添加图片描述

2. 团簇具体信息

点开团簇信息可以看到没一个团簇的大小和ID，这个可以通过Ovito输出
请添加图片描述

三、渲染团簇

1、对团簇进行选择

这里我们先根据程序识别的原子 $\rm mark$ 信息进行筛选。
请添加图片描述

2、获得团簇渲染后的结果

删除团簇内的原子，只留下渲染后的结果。
请添加图片描述

四、渲染结果

可以看到团簇的变化过程，并统计团簇信息。
请添加图片描述

五、案例dump下载

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