R语言批量读取写入Excel数据 r导出输出写入excel多个sheet 导出excel 导入 excel 读入excel 表格多个工作簿批量map

微信公众号：生信小博士单细胞——从降维聚类分群、细胞命名、到批量富集分析，一文打通GSE104154博来霉素小鼠模型单细胞数据

前一段，写过一篇：R语言中写入Excel的不同sheet表格，最近学习了tidyverse的方法，感觉需要总结一下，更新一下知识结构。

本文准备用实际数据，做一下操作：

「批量读取：」

• 批量读取多个Excel数据
• 批量读取一个Excel数据的不同表格

「批量写入」

• 批量写入Excel数据
  • 1，批量写入到不同的Excel中
  • 2，批量写入到一个Excel的不同表格中

1. 模拟数据

模拟数据的过程很简单，新建一个Excel，里面加点内容，然后复制粘贴，重命名。

❝ 懂了这么多编程知识，这一步显得不够高科技，但是确实是很直接。
❞

2. 批量读取

2.1 批量读取多个Excel数据

「步骤：」

• 先把目录下的Excel名称列出来
• 批量读取
• 后续操作

library(tidyverse)
library(openxlsx)

list_name = dir("./",pattern = ".xlsx")
list_name

re = map(list_name, ~ read.xlsx(.,sheet=1))
re
names(re) = list_name
re
write.xlsx(re,"../re_hebing.xlsx")

目录：

读取结果：

结果文件：

2.2 批量读取一个Excel的不同sheet表格

「步骤：」

• 共有8个sheet
• 批量读取
• 后续操作

name_sheet = 1:8
re2 = map(name_sheet, ~ read.xlsx("../re_hebing.xlsx",sheet=.))
re2

3. 批量写入

3.1 批量写入到不同的Excel中

「步骤：」

• 内容为list，每个元素为一个data.frame

这里，我们用re的结果：

> str(re)
List of 8
 $ a1.xlsx:'data.frame':	4 obs. of  2 variables:
  ..$ ID: num [1:4] 1 2 3 4
  ..$ y : num [1:4] 0.6275 0.4325 0.6046 0.0681
 $ a2.xlsx:'data.frame':	4 obs. of  2 variables:
  ..$ ID: num [1:4] 1 2 3 4
  ..$ y : num [1:4] 0.6275 0.4325 0.6046 0.0681
 $ a3.xlsx:'data.frame':	4 obs. of  2 variables:
  ..$ ID: num [1:4] 1 2 3 4
  ..$ y : num [1:4] 0.6275 0.4325 0.6046 0.0681
 $ a4.xlsx:'data.frame':	4 obs. of  2 variables:
  ..$ ID: num [1:4] 1 2 3 4
  ..$ y : num [1:4] 0.6275 0.4325 0.6046 0.0681
 $ a5.xlsx:'data.frame':	4 obs. of  2 variables:
  ..$ ID: num [1:4] 1 2 3 4
  ..$ y : num [1:4] 0.6275 0.4325 0.6046 0.0681
 $ a6.xlsx:'data.frame':	4 obs. of  2 variables:
  ..$ ID: num [1:4] 1 2 3 4
  ..$ y : num [1:4] 0.6275 0.4325 0.6046 0.0681
 $ a7.xlsx:'data.frame':	4 obs. of  2 variables:
  ..$ ID: num [1:4] 1 2 3 4
  ..$ y : num [1:4] 0.6275 0.4325 0.6046 0.0681
 $ a8.xlsx:'data.frame':	4 obs. of  2 variables:
  ..$ ID: num [1:4] 1 2 3 4
  ..$ y : num [1:4] 0.6275 0.4325 0.6046 0.0681

这里，我们将工作目录设置为上一级，用map2进行操作：

setwd("../")
sheet_name = names(re)
sheet_name
map2(re,sheet_name,write.xlsx)

结果：

3.2 批量写入到统一个Excel中不同sheet表格

这就不用操作，直接写入就行了，一行代码：

write.xlsx(re,"new_new_many_sheets.xlsx")

4. 知识点总结

• 使用了map和匿名函数进行批量操作
• 写入多个Excel时，用了map2函数，其实还可以用walk2函数，walk2就不会返回结果到终端了
• 默认的write.xlsx函数，支持写入list就是多个sheet表格
• 有时候重命名list更有用，比如写入到不同sheet表格中，名称就是不同sheet表的名称
• 读取不同sheet表格时，可以用1,2,3表示对应的sheet
• 另外，如果想把批量读取的Excel进行行合并或者列合并，可以用map_dfc或者map_dfr更简单。当然，后面也可以用map再做处理
• 总之，map函数就是批量操作的，越用越6

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