全基因组测序
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风澪梦宙
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在Windows系统中使用BWA更换全基因组数据参考的大致方法
一、下载工具与下载参考基因组fasta二、观察所用参考基因组三、转化原创 2022-08-09 13:21:56 · 1144 阅读 · 0 评论 -
【教程】如何使用BCFtools提取全基因组数据到芯片模拟数据?
如果您使用的是Windows系统(至少Windows 10),操作这部分的内容建议下载解压Cygwin衍生的win10tools,并打开Cygwin.bat来在Windows模拟部分Linux系统环境。文末有win10tools的下载链接,如果失效,那么需从以下链接下翻找到Win10 Release Users来下载win10tools:WGS Extract Version 3 Beta | WGSExtract.github.iohttps://wgsextract.github.io/ 接着打开使用原创 2022-06-30 16:55:05 · 2112 阅读 · 0 评论 -
常用或特别的人类fasta参考基因组下载链接
Fasta格式是一种基于文本用于表示核酸序列或多肽序列的格式,一般情况下可在大型的国际基因组网站的ftp链接下载到,文件后缀名多为".fasta"、".fa"、".fna",有的为压缩格式。比NCBI36/hg18更早的版本因为过旧,所以不显示。一、NCBI36 / hg181. Ensembl release 54(别名:Homo_sapiens.NCBI36.54.dna.toplevel )该参考的染色体编号开头不含“chr”。https://ftp.ensembl.org/pub/r原创 2022-01-18 23:56:26 · 4877 阅读 · 0 评论