Rstudio-Server调用conda环境包GLIB版本异常

实验环境：Rocky linux 9.2

R版本:4.3.2
方法一：修改R,添加conda环境路径

sudo vim /opt/R/4.3.2/lib64/R/etc/ldpaths
-----------
: ${JAVA_HOME=/usr/lib/jvm/java-11-openjdk-11.0.22.0.7-2.el9.x86_64}
: ${R_JAVA_LD_LIBRARY_PATH=${JAVA_HOME}/lib/server}
if test -n "/usr/local/lib64"; then
: ${R_LD_LIBRARY_PATH=${R_HOME}/lib:/usr/local/lib64:/data/anaconda3/envs/public/lib}
else
: ${R_LD_LIBRARY_PATH=${R_HOME}/lib:/s1/Program/anaconda3/envs/public/lib}
fi
if test -n "${R_JAVA_LD_LIBRARY_PATH}"; then
  R_LD_LIBRARY_PATH="${R_LD_LIBRARY_PATH}:${R_JAVA_LD_LIBRARY_PATH}"
fi

if test -z "${LD_LIBRARY_PATH}"; then
  LD_LIBRARY_PATH="${R_LD_LIBRARY_PATH}"
else
  LD_LIBRARY_PATH="${R_LD_LIBRARY_PATH}:${LD_LIBRARY_PATH}"
fi
export LD_LIBRARY_PATH
--------------

其中/data/anaconda3/envs/public/lib中安装了 R4.3.2，并预装了许多需要使用的库。

方法二：使用默认R自动library，然后在Rstudio-Server导入libPaths。再将/home/Your_name/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.3切换为默认路径，这样安装的库就在自己的家目录下，不影响其他人的使用。

getwd()
setwd('想要的工作目录')

.libPaths()

library(Seurat)# Error

.libPaths(c('/data/anaconda3/envs/public/lib/R/library',.libPaths()))

.libPaths()

library(Seurat)

Sys.getenv("R_HOME")
Sys.getenv("LD_LIBRARY_PATH")

#install.packages("package_name", 
#lib="/home/Your_name/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.3")

current_paths <- .libPaths()
new_paths <- current_paths

# 将第三个路径移到第一位
new_paths[1] <- current_paths[2]
new_paths[2] <- current_paths[1]
.libPaths(new_paths)
.libPaths()

方法三：找到其他位置的GLIBC_库，做一个软连接

[anaconda3]$ strings /data/anaconda3/lib64/libc.so.6 |grep GLIBC_2.3| head
GLIBC_2.3
GLIBC_2.3.2
GLIBC_2.3.3
GLIBC_2.3.4
GLIBC_2.30
GLIBC_2.31
GLIBC_2.32
GLIBC_2.33
GLIBC_2.34
__GLIBC_2_3_3_sys_siglis

[anaconda3]$ ln -s /data/anaconda3/lib64/libc.so.6 你环境的lib/libc.so.6