安装edgeR包，报错：不存在叫‘locfit’这个名字的程辑包

squite_

已于 2022-11-15 15:36:19 修改

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分类专栏：微生物组分析学习文章标签： linux r语言

于 2022-11-15 15:35:13 首次发布

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安装edgeR包：

if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
  install.packages("BiocManager")
BiocManager::install("edgeR")
library(edgeR)

Error: package or namespace load failed for ‘edgeR’ in loadNamespace(j <- i[[1L]], c(lib.loc, .libPaths()), versionCheck = vI[[j]]):
不存在叫‘locfit’这个名字的程辑包

尝试解决安装locfit包：

install.packages("https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/locfit/locfit_1.5-9.4.tar.gz",repos = NULL,type = "source")`

ERROR: compilation failed for package ‘locfit’
Warning in install.packages :
installation of package kages/locfit_1.5-9.4.tar.gz’ had non-zero exit status
解决：
install.packages("locfit",type="binary")
参考：https://zhuanlan.zhihu.com/p/438451509