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RSS订阅原创 【重磅】3分钟快速部署自己的本地Deepseek教程来啦！
研发的全新模型 DeepSeek-R1 发布，助力 DeepSeek 应用登顶苹果中国与美国 App Store 免费榜，甚至在美区超越 ChatGPT，成为 AI 领域最炙手可热的产品。本期视频由全优统计的分子生物学大佬-段老师，为大家简要讲解如何在本地部署 DeepSeek，视频时长仅 1 分40秒。刘伟指出，大模型的发展正在经历变化，传统上，模型的优劣往往取决于算力的规模，但 DeepSeek 给出了另一种可能——发布以来，我们便开始关注其性能，没想到在春节假期短短几天内，它已然火爆全网！
2025-03-03 16:35:13
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原创 仅基于6篇文献的危险因素Meta分析也能发表一区SCI！
作为经典的，凭借整合研究结果、提高统计效能和提供高质量证据的优势，经久不衰。在发表高水平论文方面具有极高潜力，因此长期以来是。今天我们来看一篇仅纳入6篇文献的危险因素Meta分析，成功发表在中科院二区期刊IF 9.1。这项研究通过系统性文献回顾和Meta分析，探讨了关键细胞因子（如IL-6和IL-1β）与高血压发生之间的潜在关联，并通过整合现有证据，为炎性因子在高血压发病机制中的作用提供了新的见解。
2025-03-03 16:20:37
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原创 【生信分析】华西团队火力全开，“共病分析”玩出新高度！7分+挺进1区，这思路绝了！
还想纯生信发文？这样做就对了！肿瘤与非肿瘤方向皆可开展的共病分析课题！共病是指个体同时患有两种或更多的慢性疾病或医疗状况，既可以是一种疾病诱发另一种（如非肿瘤疾病导致肿瘤发生），也可以是两种疾病独立存在但共存的情况。选择创新性强的疾病组合，不仅能减少繁琐的分析与实验铺垫，还能大幅提高文章的发表潜力！今天，我们来分享一篇创新的经典案例：整合了转录组学+生信分析，研究质量颇高，亮点突出。这篇文章的选题方向是幽门螺杆菌感染相关胃癌的关键基因与机制。来自四川大学华西医院团队的文章，整合scRNA - seq明确基因
2025-02-25 15:42:07
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原创 Nature子刊：P＜0.05只是起点，统计意义之外更需关注临床意义
以血红蛋白（hemoglobin，Hb）为效标，估算促红素治疗白血病患者贫血的健康相关生活质量量表（health-related quality of life，HrQOL）的 MCID，采用线性回归模型建立量表和 Hb 两者变化值的回归方程（ΔHrQOL=α+βΔHb+ε，其中 α 为常数项，β 为回归系数，ΔHb 为 Hb 变化的截点值，ε 为误差项）。效标法，亦翻译为锚定法，又称“外部参照”法，是通过检验目标测量工具与另一个独立的测量工具（外部效标）的关系来阐明目标测量工具数值变化的含义。
2024-12-16 15:41:15
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原创 【孟德尔】玩的就是套路，生信联合分析照样上大分
对肺癌GWAS数据的曼哈顿图分析显示，在22条染色体上存在多个显著的SNP位点，其中最显著的位点位于染色体2（p < 10⁻⁴）。转录组数据集包括：GSE81089（n=107）、GSE13213（n=117）、GSE14814（n=71）、GSE26939（n=115）、GSE31210（n=226）、GSE30219（n=85）、GSE37745（n=106）、GSE50081（n=127）、GSE42127（n=133）、GSE72094（n=398）和GSE68465（n=442）。
2024-12-16 15:37:04
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原创 【伞状Meta】这样写伞状Meta轻轻松松破一区Top刊！
分别展示了IBD、UC和CD的图表，涵盖发病率、进展和复发。该团队还重新分析了荟萃分析中展示的主要研究，呈现与不同种类的肉类和肉制品相关的关联，使用相对风险和95%置信区间作为效应估计，并采用随机效应模型生成最高摄入与最低摄入的汇总相对风险。总之，高摄入水果和蔬菜显著降低UC和CD的发病风险，而地中海饮食、素食及半素食饮食同样与IBD的发病率和进展减缓相关。而伞状综述则能够提供更为全面的认知，它汇总了针对特定主题的高质量研究结果，既节省了时间，又能提供更高等级的证据，提升了临床问题解决的时效性和可行性。
2024-12-11 14:25:48
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原创 【孟德尔】瑞金医院突破性研究：全转录组MR+动态单细胞eQTL数据，打破常规孟德尔随机化
本研究鉴定了162个与2型糖尿病（T2D）相关的推定因果基因和80个与冠心病（CAD）相关的推定因果基因，其中9%的基因-疾病对仅通过免疫细胞特异性的eQTL（表达数量性状位点）能够识别。通过细胞类型和激活时间点特异性分析，本研究进一步拓展了我们对T2D和CAD相关基因表达模式的理解。研究结果突显了免疫与代谢途径交汇的重要性，并为开发针对心脏代谢疾病的免疫调节药物提供了新的研究方向。
2024-12-11 14:22:26
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原创 IF=93.6的成功经验与伞形综述解析
对于证据使用者而言，在面对同一疾病的多个临床问题时，往往需要检索和阅读大量的系统评价，这既耗时又费力。而伞状综述则能够提供更为全面的认知，它汇总了针对特定主题的高质量研究结果，既节省了时间，又能提供更高等级的证据，提升了临床问题解决的时效性和可行性。伞状综述（Umbrella Review，UR），也被称为伞形评价或系统评价再评价（Overviews of Systematic Reviews, OoSRs），是近年来在国际上兴起的一种新型综述评价方法。它通过对某一研究主题的所有。
2024-12-09 18:48:02
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原创 【生信刺客】11分的WGCNA+网络药理学+分子对接+体内外实验
处理前24小时进行血清饥饿，HSF细胞用1、5或10 µmol L–1的crizotinib、sorafenib或SU11274处理，DMSO 1%处理的HSF细胞和正常成纤维细胞作为对照。实际上，选题对研究至关重要，这篇文章深入探讨了增生性瘢痕的分子机制，并筛选了有效的治疗药物，展示了从关键基因筛选到候选药物筛选，再到实验验证药物功效和机制的完整研究过程，具有良好的逻辑性。从黑色模块中选择了GS最高的150个基因，并从青色、蓝色、皇家蓝、松石色和浅青色模块中选择了另一组GS最高的150个基因。
2024-12-09 18:39:16
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原创 单细胞测序YYDS！掌握‘单细胞测序+分子机制研究’的分析套路，发文像开挂一样
本文通过对14位脊索瘤患者样本进行单细胞RNA测序，揭示了脊索瘤的细胞异质性及其肿瘤微环境中的关键信号通路，尤其是TGF-β和VEGF信号通路。研究中构建了两种靶向VEGFR的CAR-T细胞结构，均包含4-1BB共刺激域，分别为VEGFR CAR和VEGFR/TGF-β scFv CAR。体外实验结果表明，VEGFR/TGF-β scFv CAR-T细胞在抑制TGF-β引起的免疫抑制和增强细胞毒性方面展现出显著优势。
2024-11-16 18:34:18
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原创 科研新玩法：Meta分析与真实世界研究的完美结合
总的来说，地诺单抗治疗可能是一种有效的策略，能帮助高危骨质疏松症患者避免发展为2型糖尿病（T2D），相较于双膦酸盐治疗。在骨质疏松症和已经确诊为T2D的患者中，选择地诺单抗可能有助于降低全因死亡率和足部溃疡的发生风险，尽管可能会增加肾病的风险。这些发现为未来的随机对照试验（RCT）提供了重要的信息，有助于进一步验证或否定我们的研究结果。将传统的Meta分析与数据库整合，不仅创新了研究思路，还能有效弥补因纳入研究数量不足导致Meta分析说服力不足的缺陷。这种方法增强了结果的稳健性，使得研究结论更具科学依据。
2024-11-05 16:16:43
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原创 6分钟看懂分子生物学聚合酶链式反应(PCR)
通过在PCR中将目标DNA在琼脂糖凝胶上进行电泳或在qPCR中使用相机进行检测，可以观察到这些DNA。在qPCR中，带有不同颜色标签的探针可以在每个试管中同时扩增多个目标。PCR和qPCR广泛应用于疾病诊断和医学研究。在现代生物科学中，聚合酶链反应（PCR）是一项革命性的技术，它改变了我们对DNA的认识和应用。无论是在医学诊断、遗传研究，还是在法医科学中，PCR都发挥着至关重要的作用。例如，在呼吸道感染中，qPCR测试能够检测到存在的病毒和细菌。因此，利用qPCR中的探针，可以在一个样本中检测到多个目标。
2024-11-05 16:08:52
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原创 同一天连发两篇《柳叶刀》正刊！“网状Meta”再次发挥了重要作用！
但现有的荟萃分析主要集中在这一类药物上，未评估其他抗病毒药物对重症人畜共患流感的影响，也缺乏对证据质量的评价。传统Meta分析通常只对比两种干预措施的效果，而网状Meta分析（NMA）则能够整合来自多个随机对照试验（RCT）的数据，通过共同的比较对照（如安慰剂或标准治疗）来推导出不同干预措施之间的相对效果。总体而言，作者团队的研究为奥司他韦和帕拉米韦在重症季节性流感治疗中的使用提供了一定依据，但强调了治疗效果的不确定性，并呼吁进行更多临床试验，以深入了解这些药物的临床益处和安全性。
2024-10-14 17:07:01
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原创 将传统的meta分析与孟德尔随机化结合，跟随顶级期刊找灵感！
研究人员在元分析和孟德尔随机化分析中发现高血清同型半胱氨酸浓度与NAFLD风险增加之间的一致关联。在元分析中，高血清叶酸与NAFLD风险降低呈负相关。结果支持同型半胱氨酸浓度升高在NAFLD发展中的潜在作用，并暗示叶酸水平升高可能降低NAFLD的发病风险。尽管研究方法看似简单，结合元分析与MR分析的常规套路，却能够实现1+1>2的效果，产生更有力的结果。这种方法确实为因果推断提供了更强的支持。
2024-10-09 17:57:09
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原创 学习干货IF=93.6！开发临床预测模型：分步指南
候选预测变量我们应根据文献综述和专家知识确定潜在的预测因子（第1步）。这些因子应使用既定的、可靠的方法进行客观定义和衡量，同时理解支持预测因子与结果关联的生物途径是关键。应优先纳入已证实或怀疑与结果有因果关系的预测因子，以提高模型的泛化性。但不应先验排除与结果没有因果关系的潜在预测因子，因为它们可能仍对模型性能有帮助。我们必须仅包括基线预测因子，即在做出预测时可获得的信息。对连续预测变量进行二分法或分类会减少信息并削弱统计能力，应避免。
2024-10-09 17:47:38
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原创 【Meta分析】IF=12.1!人工智能预测模型Meta分析怎么做？
这项元分析表明，人工智能（AI）在骨折检测的诊断性能上与临床医生相当，展现了作为诊断工具的潜力。然而，许多研究因方法缺陷或数据集不具代表性而限制了其实际应用。未来研究应优先考虑务实的算法开发，确保数据反映目标人群特征，并客观评估样本量充分性。此外，鼓励跨中心共享数据和代码，以提高研究的可重复性和透明度。AI旨在作为诊断辅助工具，改善工作流程并提高诊断确定性，但不能替代临床工作，临床医生需理解其性能并进行判断。通过解决这些问题，深度学习有潜力安全、可持续地简化骨折诊断。Meta 分析火了十年了，还流行么？
2024-09-20 16:39:59
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原创 安徽医科大学：利用UKB数据库和孟德尔随机化，研究发表更轻松！
基于这些生物标志物，研究计算了三种不同的估计肾小球滤过率（eGFR）：分别基于血清肌酐的eGFR（eGFRcr）、基于血清胱抑素C的eGFR（eGFRcys）以及结合胱抑素C和肌酐的联合eGFR（eGFRcr_cys）。对于睡眠模式不良且RFS（加权肾功能生物标志物评分）最高的参与者，新发严重代谢功能障碍相关脂肪性肝病（MASLD）的风险增加了5.45倍。同时，肾功能受损是否会增加新发严重MASLD的风险，以及睡眠、肾功能与严重MASLD发病之间是否存在更深层次的内在关联，仍然是尚未充分探索的问题。
2024-08-20 16:00:34
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原创 均数(mean±SD)与RR/OR值可以合并进行Meta分析吗？
在做危险因素的Meta分析时，遇到一些文献比较的是病例组和对照组某一指标的均值差异，数据以mean±SD形式呈现，而另一些文献则是以OR或RR (95%CI)的形式描述该指标与疾病的关联。这两种数据形式可以一起进行Meta分析吗？
2024-08-15 18:04:33
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原创 影响因子30+的SCI教你如何进行单个率Meta分析！
全球非酒精性脂肪性肝病（NAFLD）的负担与肥胖率的上升密切相关。尽管超重和肥胖被认为是筛查NAFLD的有效指标，但NAFLD在这一人群中的具体流行率仍然不明。提到患病率，大家可能已经猜到这是一项单个率的Meta分析。这项Meta分析纳入了151篇文章，选题合理，分析方法得当，研究质量极高，发表在《柳叶刀》子刊上，堪称单个率Meta分析的典范。
2024-08-15 18:00:30
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原创 厉害了！交大学者运用孟德尔随机化中介分析登上Nature子刊！
此外，幸福感对衰老-GIP的因果影响部分通过33个可修改的中介来解释，包括生活方式（如看电视、吸烟和饮食习惯）、行为和表现（如药物使用和认知能力）、身体功能（如肥胖、血脂、肌肉质量和炎症）以及疾病（如心血管疾病、注意力缺陷多动障碍、糖尿病和乳腺癌）。此外，幸福感与较高的衰老-GIP独立相关，调整收入（β=1.00，P=7.25×10^-27）、教育（β=1.01，P=4.04×10^-31）和职业（β=1.07，P=4.50×10^-38）后结果仍然显著。
2024-08-03 20:50:56
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原创 提升工作效率的秘诀：这5项ChatGPT设置你必须知道！
例如，如果你是老师或家长，并且希望所有生成的回答都符合孩子的年龄，你可以使用自定义指令功能。在第二个框中，你可以具体指定希望的回答风格，比如“请使用通俗易懂的语言来回答，让7岁的孩子也能理解答案，避免使用成人语言，并保持语气生动有趣，积极乐观”。关于隐私和安全问题，如果你不想让你的聊天记录被用来进一步训练模型，你可以关闭“为所有用户改进模型”的设置。这一点尤为重要，因为该功能默认是开启的。“记忆”功能与“自定义 ChatGPT”一样，可以让你避免每次使用聊天机器人时都重复相同的信息，从而获得更好的体验。
2024-07-15 17:31:34
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原创 告别混乱的文献管理！免费科研软件——Zotero
如果你在进行学术研究，免不了要收集大量的论文、书籍和网页文章，以方便支持你的研究，但是数量庞大且所需信息纷繁复杂的情况下，该怎么高效地保存这些数据呢？使用Zotero除了下载桌面应用程序，它还提供了浏览器插件，因此，为了更方便的使用Zotero，你还需要根据你使用的浏览器（Chromo、Firefox或者Safari），安装相应的浏览器插件。如图是word中Zotero的选项卡，一般在安装时就会提示装word插件，之后在word编辑文本时，就可以快速地插入引文。gz*h：全优统计，更多科研资讯。
2024-07-15 17:27:55
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原创 提升Meta分析可信度：GRADE方法在应对高异质性中的应用
在进行Meta分析时，可能会遇到异质性问题，特别是在异质性较高的情况下，如何有效减少异质性或巧妙解释其存在，成为一个挑战。今天，为大家介绍一个全新的解决方案——GRADE证据分级。这种方法不仅帮助我们系统地评估证据的质量，还提供了一种结构化的途径来处理异质性问题。
2024-07-10 17:26:55
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原创 Engauge Digitizer联合Excel模板从生存曲线提取HR值
常见的方法之一是利用Engauge Digitizer等工具将生存曲线数字化，然后使用Jayne F Tierney等人制作出的Excel计算工具估计出HR。
2024-07-10 17:11:59
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原创 【孟德尔随机化】这篇高级孟德尔随机化研究：药靶、共定位，发文一区（IF=8.9）！
今天分享一篇高分孟德尔随机化研究！现在越来越多的学者在用孟德尔随机化高级方法发文，今天分享的这篇这篇药靶孟德尔随机化，用了共定位分析方法，设计严谨，思路绝妙！羡慕别人的同时，你也可以利用完成一项大事！那就是。
2024-07-01 17:38:12
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原创 【Meta分析】纳入大样本原始研究的meta分析轻松拿下一区10+？
这限制了及时识别和诊断。目前，50岁以下人群从症状出现到确诊结直肠癌的平均时间较长，通常为4至6个月。识别高危症状并缩短确诊时间对于改善早发型结直肠癌的预后至关重要。
2024-07-01 16:46:09
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原创 探索AI医疗：GPT-3.5与GPT-4.0的疾病问答实力对比
这项研究旨在评估和比较ChatGPT-3.5和ChatGPT-4.0在解答有关急性胰腺炎的问题时的表现，使用了主观和客观的评估方法。本研究的创新之处在于系统性地比较了ChatGPT的两个版本在提供临床医学信息方面的表现，深入分析了它们在不同类型问题上的优势和限制。研究结果揭示了ChatGPT-4.0在回答主观问题方面表现优越的特点，同时也指出了ChatGPT在处理涉及复杂临床特征的问题时的挑战。
2024-07-01 16:31:25
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原创 审稿人：那么好发的单细胞测序的生信分析都还没人做吗？
此外，研究还发现SPP1在巨噬细胞中的表达水平在HSIL和CC中上调，而CD44在上皮细胞中的表达在HSIL中也有所增加，这进一步支持了SPP1-CD44轴在宫颈癌发展中的潜在作用。同时，作者鉴定了几个新基因，包括SRGN和HIST1H1C。T细胞亚群分析显示，CD8+ T细胞的比例在LSIL中下降，但在HSIL和CC中上升，表明保护性的T细胞免疫反应在HSIL中开始建立。这些数据为改善宫颈癌的早期诊断、优化患者分层提供了更深入的见解，并为未来的研究提供了宝贵的资源，以发现新的生物标志物和潜在的治疗靶点。
2024-06-10 20:12:34
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原创 如何使用STATA将网状meta的SUCRA曲线合并在一张图上
① 从数据名称来看，我们会发现数据是有规律排布的，在此案例中8个（zero-H）为一组。我们需要将每8个数据依次排列下来，成为8*8的表格。执行完原有的SUCRA命令以后，在数据编辑器会看到如图所示的数据，将probmin_zero及之后的所有数据复制到EXCEL表中。科研图表在科学研究和学术传播中扮演着至关重要的角色。美观且清晰的图表不仅能够准确传达复杂的信息，还能增强读者的理解和兴趣。④ 接下来，如图所示，每一行的数据都是前面几行数据的总和。② 排列好以后的数据如下图所示，成为8*8的表格。
2024-06-10 19:57:40
1880
原创 Endnote参考文献格式下载教程
9.关闭Style Manager，打开Word文档，找到工具栏里的EndNote x9 Style，然后选择对应的格式即可。7.保存到EndNote文件夹里面的Style中（文件所在位置可能不同，默认c盘，但因人而异）2.然后找到Output Style--点击Open Style Manager。8.保存后，打卡EndNote，关闭Style Manager，并重新打开。1.打开EndNote页面--找到工具栏里的Edit。5.搜索并找到相应期刊格式，然后点击下载。3.点击查找更多，网页下载。
2024-03-05 17:31:19
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原创 基于Stata的生存资料的meta分析代码
Meta分析一般步骤：1.异质性：得到汇总结果以及各研究间数据差异I2：异质性大小（常见I2大于等于50选择随机效应模型亚组：二分类变量回归：连续性变量------纳入文献需要10篇2.敏感性分析：评价结果稳定性3.发表偏倚：评价meta分析最常见的系统误差识别：漏斗图Begg检验、Egger检验------纳入文献需要>5篇或>8篇发表偏倚处理(剪补法、失安全系数法)---------存在发表偏倚时才进行此项分析。
2024-03-04 16:13:46
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原创 基于Stata软件网状Meta分析的实现-网图和漏斗图
可能报错：variables study treatment do not uniquely identify the observations 提示同一篇文章的臂必须不一样。解读：圆圈大小代表进行相应干预措施患者的样本量大小，圆越大相应干预措施患者的样本量元多；线条粗细代表两两干预措施研究数量，越粗两两干预研究越多。漏斗图带回归线的意义：矫正的作用，解读依然正常解读：看对应颜色的对称情况，但是主观上看不出来，直接放就是。(意味着有2组数据未形成网)更多精彩内容，请关注同名公。
2024-02-02 18:55:19
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原创 ChatGPT制定Meta分析的文献检索策略，准确性如何?
为了执行比较性搜索策略的分析，作者使用了PROSPERO平台提供的记录(#CRD42023391396)，旨在回答中心问题：“肥胖个体在进行了减重手术后何时出现体重再增？在这封信中，作者对ChatGPT在解码核心问题并搜索世界范围内三个用于指导研究人员和方法学家的数据库中的整个文献的能力进行了关键评估。对于作者提到的问题，除了第4点作者在给ChatGPT命令时并没有提及外，另外三点的的确确存在这样的问题。1. ChatGPT没有在检索策略中插入同义词（Entry Terms）和研究者临床实践中常使用的词。
2024-02-02 03:50:49
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原创 纳入文献无均数与标准差？Meta分析连续性数据的深度提取。
当我们在做Meta分析时，合并的结局指标包含五大类，分别是二分类数据、连续性数据、有序数据、计数或率、时间-事件数据。其中，连续性数据意指在特定范围内可取任何值的数据，如身高、体质量、面积等。对连续性数据进行 Meta 分析时，合并的统计量为“均数差”（mean difference, MD），即两组间均数的差值。然而，我们常常面临一个挑战：数据获取和处理。我们需要样本量、均数和标准差，但并非每篇文献都提供完整信息。如何解决这一难题呢？让我们一起探索对连续性数据的深度提取方法。
2024-01-25 17:20:43
2500
原创 Stata软件network组命令在网状Meta分析中的应用
Stata软件的mvmeta命令通过拟合多变量模型进行网状Meta分析，但仍存在诸多挑战，如数据预处理、 模型参数化、结果图示化等，而 network 组命令可以较好地应对这些挑战。本文以连续型数据为例，介绍如何使用 network 组命令进行网状 Meta 分析。
2024-01-25 16:11:46
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