学习笔记 — TCGA 生存分析理论+R语言实践

一、生存分析的基本概念

1. 生存时间：从规定的观察起点至事件终点出现所经历的时间长度。

2. 生存数据：① 完全数据：准确的生存时间；② 删失数据/截尾数据：由于某种原因无法观察到事件终点出现的数据。

删失数据的原因包括：1）研究结束时终点事件未发生；2）失访；3）研究对象因其他原因死亡或无法耐受而终止观察。

1号和5号 观察期间内患者死亡，为完全数据；

2号在观察结束后死亡、3号失访、4号始终未观察到终点事件，这3个数据为删失数据。

二、 生存分析的常用指标

1. 中位生存期（Median survival time）：50%个体存活的时间。

2. 生存函数（Survival function）：某时刻观察对象仍然存活的概率，与时间相关，又称积累生存率。

3. 风险函数（Hazard function） ：某时刻观察对象的瞬时死亡率。

三、Kaplan-Meier 生存曲线

Kaplan-Meier法，即计算的是上述概念所提到的积累生存率，是一种单因素生存分析方法，可用于研究1个因素对于生存时间的影响。

• 曲线上的“+”表示删失数据；
• 曲线越高、下降越平缓表示生存率越高或预后越好；
• 曲线越低、下降越陡峭表示生存率越低或预后不佳；
• 蓝色圈表示中位生存期，肿瘤直径>5cm组中位生存期约23月，≤2cm组约45月；

四、生存率的比较

1. 单因素分析方法检验

非参数检验方法使用较为广泛，主要包括log-rank检验和Breslow检验，二者都属于卡方检验。

• log-rank检验给组间死亡的远期差别更大，即log-rank方法对远期差异敏感。
• Breslow检验给组间死亡的近期差别更大，即Breslow方法对近期差异敏感。