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机器学习之DeepSequence软件使用学习3-预测突变效应
我们将介绍加载模型和预测突变影响的基本函数。原创 2024-03-05 22:23:29 · 536 阅读 · 0 评论 -
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在学习1中粗略地运行了一下软件的例子文件,但其中的很多东西都未能理解。该文中主要是对helper模块中代码的初步注释及学习以求能够熟练使用该软件。原创 2024-02-06 00:47:44 · 426 阅读 · 0 评论 -
机器学习之DeepSequence软件使用学习1
DeepSequence 是一个生成性的、无监督的生物序列潜变量模型。给定一个多重序列比对作为输入,它可以用来预测可获得的突变,提取监督式学习的定量特征,并生成满足明显约束的新序列文库。它将序列中的高阶依赖性建模为残差子集之间约束的非线性组合。要了解更多信息,请查看论文(https://www.biorxiv.org/content/early/2017/12/18/235655.1)和下面的例子。原创 2024-02-02 01:16:30 · 593 阅读 · 0 评论