R语言常用基础命令总结

1. 当某个函数使用有冲突时，可以在函数前面加上相应包的信息：dply::filter ()

2. 取一个矩阵中的某些行，subset（a, condition）, 根据condition中的条件判断，判断为T的行留下，为F的行去掉，重新组成一个小矩阵

3. 矩阵除以一个与期行数目相等的向量，运算规则是，每一行的每列对应的数值除以对应的行位置的向量的值。

4. 在使用merge函数对基因的表达矩阵合并时，最好不要根据gene_symbol来合并，不同的数据库会用不同的gene_symbol，这会导致在merge时丢失数据；最好使用gene_id来进行merge。

5. 时刻要记住做质量控制qc，在得到矩阵后，一定要检查矩阵的正确性；一个是可以用na.omit来观察有无na数据，二是可以用distinct函数来去除重复的行。这样能避免后续对该矩阵的运算出错。

6. 产生2水平，每个水平重复3次的序列，序列长度为12

gl(2, 3, labels = c('male', 'female'), length = 12)