WGCNA(加权基因共表达网络分析)
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wangchuang2017
天下才子,中州过半
惟楚有才,于斯为盛
实事求是,知行合一
师者,所以传道,授业,解惑也
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线性加权和法
线性加权和法是一种评价函数方法。是按各目标的重要性赋予它相应的权系数,然后对其线性组合进行寻优的求解多目标规划问题的方法。对于问题(VMP),即归结为求:[1]的最优解,其中wk≥0(k=1,2,…,m)为权系数,且:[2]评价函数方法编辑语音评价函数方法是一类求解多目标规划问题的方法。是通过构造一个把多个目标转化为单个数值目标的评价函数,将多目标规划问题归结为求解相应评价函数的数值最优化问题的方法的统称。一般地,采用不同形式的评价函数可求得多目标规划问题的不同意...原创 2021-09-30 16:35:52 · 4441 阅读 · 0 评论 -
WGCNA算法研究笔记
WGCNA算法研究笔记研究了近半年的算法,记录下来给自己一个交代,也应该是考G前地最后一篇日志了。Weighted Gene Co-Expression Network Analysis中文名有翻译成加权关联网络分析的,感觉不是很恰当,英文来得比较直接。本来是佟昊从老汪那拿的一个课题,因为看起来比较有意思就把文章找来慢慢啃,到现在算是捣鼓出点名堂了。方法是UCLA的一个教授提出来的,在文章中他将其归类到系统生物学的研究方法中,不过个人认为由于其分析水平还是只停留在DNA芯片上,并未到达系统的程度,但原创 2021-02-20 10:54:31 · 1038 阅读 · 0 评论 -
WGCNA(加权基因共表达网络分析)
WGCNA(加权基因共表达网络分析)序章这个工具现在很火,高分文章用到很多。加权基因共表达网络分析(WGCNA,Weighted gene co-expression network analysis) WGCNA能够从复杂数据中(N多分组)快速地提取出与样本特征相关的基因共表达模块,以供后续分析。简单地说,它通过计算基因之间的表达相关性,将具有表达相关性的基因聚类到一个模块中,然后再分析模块与样本特征(包括临床特征、手术方式、治疗方法等等)之间的相关性,WGCNA搭建了一座样本特征与基因表达原创 2021-02-20 10:16:38 · 13330 阅读 · 6 评论