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原创 白墨的生物信息自学之路
进入21世纪后，组学数据井喷式产出，随之而来的问题是如何处理这些数据，挖掘背后隐藏的价值。人们想到利用包括计算机，物理学，数学，统计学在内学科的优势去解析这些大数据，随之催生出一门新的交叉学科，这就是生物信息学。这门学科为生物进化，物种分类，育种技术，药物设计等领域起到巨大的推动作用。不仅使我们更加全面的认识生命，而且随之带来了丰厚的社会效益。这里记录了我学习生物信息时，在平坦道路上曲折前行的步伐。可以为打算学，正在学生物信息的同学提供一些参考，少走一些弯路。让我们一起披荆斩棘，乘风破浪。这.
2020-12-16 10:50:05
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原创 一文读懂三维基因组
文章目录一、细胞核 *Nucleus*二、染色质疆域 *Chromosome Territory，CT*三、染色质区室 *A/B compartments*四、拓扑结构域 *Topologically associating Domains，TAD*五、层关联域 *Lamina Associating Domains，LAD*六、核仁关联域 *Nucleolar Associating Domains，NAD*七、染色质环 *Chromatin loops*每个人体内都有着两米长的DNA，它是如何紧密折叠
2020-12-25 16:56:37
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原创 Python 自动化提取基因的 CDS
文章目录一、环境准备及背景介绍二、Python 实现三、使用示例数据介绍1、提取单个基因CDS2、提取多个基因CDS2、提取全部基因CDS一、环境准备及背景介绍Python 开发环境：搭建 Python 高效开发环境： Pycharm + AnacondaBiopython 序列处理：生物信息中的 Python 02 | 用biopython解析序列示例 Genbank 数据：下载链接Genbank 数据介绍：生物信息中的Python 05 | 从 Genbank 文件中提取 CDS 等其他特征序
2020-12-21 09:59:27
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原创 Markdown 数学公式写法与速查表
文章目录一、公式写法二、基础公式三、关系运算符四、集合运算符五、戴帽符号六、连线符合七、矩阵八、分段函数九、希腊字母一、公式写法公式语法：$$H(X) = -\sum{P(x)logP(x)}H(X)=−∑P(x)logP(x)H(X) = -\sum{P(x)logP(x)}H(X)=−∑P(x)logP(x)带标号的公式语法：$$H(X) = -\sum{P(x)logP(x)} \tag1$$H(X)=−∑P(x)logP(x)(1)H(X) = -\sum{P(x)logP(x)
2020-12-12 10:52:40
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生物信息聚类热图_示例数据
2019-09-08
空空如也
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