图核graph kernel方法Python工具包graphkernels的安装和使用

最新推荐文章于 2024-09-11 17:05:32 发布
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分类专栏： python LeetCode graph data 文章标签： python graph Kernel graph data
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本文介绍了如何在Python中安装和使用graphkernels工具包进行图核计算。详细阐述了通过源码安装graphkernels及其依赖库GKextCPy的步骤，包括解决安装过程中遇到的Eigen库问题。并简单提及了graphkernels包的使用流程，涉及数据加载和计算WL核的示例。
摘要由CSDN通过智能技术生成

图核graph kernel是一种有效的图结构相似度的近似度量方式，针对不同的图结构(labeled graphs, weighted graphs, directed graphs, etc.) 有不同的Graph kernel。

这里，我们不介绍graph kernel的算法理论，只是简单介绍下其Python工具包graphkernels的安装和使用。


graphkernels是由ETH Machine Learning&Computational Biology Lab出品的，目前的版本是graphkernels 0.1.8


一.安装

graphkernels的GitHub主页上提供了两种安装方式：

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