cupy系列(一)——自定义elementwise核函数

定义elementwise核函数

Type-generic 核函数

>>> squared_diff_generic = cp.ElementwiseKernel(
...     'T x, T y',
...     'T z',
...     'z = (x - y) * (x - y)',
...     'squared_diff_generic')

解释

  • 采用T作为类型占位符,T具体指代的类型依次由:输出,输入。及首先看输出的类型,输出没有制定,则用输入的数据类型。

例子一

import cupy as cp
import numpy as np

squared_diff_generic = cp.ElementwiseKernel(
'T x, T y',
'T z',
'''
T diff = x - y;
z = diff * diff;
''',
'squared_diff_generic')

x = cp.arange(10, dtype=np.float32).reshape(2,5)
y = cp.arange(10, dtype=np.float32).reshape(2,5)
squared_diff_generic(x, y, z)
>>>array([[0., 0., 0., 0., 0.],
       [0., 0., 0., 0., 0.]], dtype=float32)

这里的z没有指定类型,所以用的是输入的float32类型

例子二 多个类型占位符

import cupy as cp
import numpy as np

squared_diff_super_generic = cp.ElementwiseKernel(
'X x, Y y',
'Z z',
'z = (x - y) * (x - y)',
'squared_diff_super_generic')

x = cp.arange(10, dtype=np.float32).reshape(2,5)
y = cp.arange(10, dtype=np.float32).reshape(2,5)
squared_diff_super_generic(x, y, z)

>>> NameError: name 'z' is not defined

修改

import cupy as cp
import numpy as np

squared_diff_super_generic = cp.ElementwiseKernel(
'X x, Y y',
'Z z',
'z = (x - y) * (x - y)',
'squared_diff_super_generic')

x = cp.arange(10, dtype=np.float32).reshape(2,5)
y = cp.arange(10, dtype=np.float32).reshape(2,5)
z = cp.empty(10, dtype=np.int16).reshape(2,5)
squared_diff_super_generic(x, y, z)

>>>array([[0, 0, 0, 0, 0],
       [0, 0, 0, 0, 0]], dtype=int16)

手动索引

ElementwiseKernel类使用广播自动执行索引,这对于定义大多数elementwise计算非常有用。另一方面,我们有时想为一些参数编写一个手动索引的内核。我们可以告诉ElementwiseKernel类使用手动索引,方法是在类型说明符之前添加raw关键字。
我们可以使用特殊的变量i和方法_ind.size()进行手动索引。i表示循环中的索引。size()表示应用elementwise操作的元素总数。注意,它表示广播操作之后的大小。

例子一 向量相加,其中一个反序

import cupy as cp
import numpy as np

add_reverse = cp.ElementwiseKernel(
'T x, raw T y', 'T z',
'z = x + y[_ind.size() - i - 1]',
'add_reverse')

x = cp.arange(10, dtype=np.float32)
y = cp.arange(10, dtype=np.float32)
z = cp.empty(10, dtype=np.float32)
add_reverse(x,y,z)

>>> array([9., 9., 9., 9., 9., 9., 9., 9., 9., 9.], dtype=float32)

关键

  • i:循环中的索引
  • _ind.size():元素的总数
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可以通过使用dask-cuda和cupy来在GPU上执行Dask自定义函数代码。您可以使用以下步骤: 1. 安装dask-cuda和cupy:`pip install dask-cuda cupy` 2. 在Dask集群中启用CUDA:`from dask_cuda import LocalCUDACluster` ,然后用`LocalCUDACluster()`创建集群。 3. 创建自定义函数,使用`cupy.asarray`将数据转换为CuPy数组,并使用CuPy函数执行操作。将结果转换回标准NumPy数组。 4. 使用`dask.delayed`装饰自定义函数,以便Dask可以在集群上并行化计算。 5. 使用`dask.compute`函数运行任务并获取结果。 请参阅以下示例代码: ``` from dask_cuda import LocalCUDACluster import dask_cudf import cupy as cp import dask # Start a Dask CUDA cluster with 2 workers cluster = LocalCUDACluster(n_workers=2) # Create Dask CUDA DataFrame with some data df = dask_cudf.from_cudf(cudf.DataFrame({'a': cp.array([[1, 2], [3, 4]]), 'b': cp.array([[5, 6], [7, 8]])})) # Example custom function @dask.delayed def my_function(data): # Convert data to CuPy array data = cp.asarray(data) # Calculate sum of columns result = cp.sum(data, axis=0) # Convert result to standard NumPy array result = cp.asnumpy(result) return result # Call custom function on Dask CUDA DataFrame result = df.map_partitions(my_function).compute() print(result) ``` 运行以上代码后,将在CUDA集群上并行执行自定义函数,并打印结果。请注意,由于经过延迟装饰器,最终的`result`变量将是Dask延迟对象。可以通过将其转换为标准NumPy数组来获取实际结果。

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