R语言绘制热图Heatmap

热图,适合二维数据表的可视化,数值用颜色显示。

细活在于调颜色,给人感性的、辨识度高的认识。


nba <- read.csv("d:/ppg2015.csv", sep=",")

nba <- nba[order(nba$PTS),]; #按场均得分排名
row.names(nba) <- nba$PLAYER;#行名为球星名
nba <- nba[,-c(1:4,8,10,12)]

nba_matrix <- data.matrix(nba)

nba_heatmap <- heatmap(nba_matrix, Rowv=NA, Colv=NA, col = topo.colors(16),scale="column", margins=c(5,10))


Heatmap颜色的设置还是很关键的,直接体现你这幅图的效果了。
R中颜色调色板很多:
(1)简单的
heat.colors(n, alpha = 1)
terrain.colors(n, alpha = 1)
topo.colors(n, alpha = 1)
cm.colors(n, alpha = 1)
比如,col=cm.colors(256))  #这里的颜色设置为n=256种,如果为2,做出的图就有两种颜色,不是你颜色设置越多越好,根据自己的需要而定(即合理的设置n)。
(2)复杂的
rainbow(n, s &#
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