在线作图丨数据降维方法③——正交偏最小二乘方判别分析(OPLS-DA)

本文介绍了正交偏最小二乘方判别分析(OPLS-DA)的概念,它是PLS-DA的一种改进,能够滤除无关噪音并提高模型解析能力。OPLS-DA常用于代谢组学分析,通过建立回归模型来区分样本类别。此外,文章推荐了一个名为云图图的在线作图平台,用户可以免费绘制OPLS-DA图,只需上传数据和设置参数。
摘要由CSDN通过智能技术生成

​Question1:什么是PLS-DA?
与PCA不同,PLS是“有监督”模式的偏最小二乘法分析,也就是在分析数据时,已知样本的分组关系,这样可以更好的选择区分各组的特征变量,确定样本之间的关系。DA是判别分析,PLS-DA用偏最小二乘回归的方法,在对数据“降维”的同时,建立了回归模型,并对回归结果进行判别分析。
OPLS-DA是在PLS-DA的基础上,进行了正交变换的矫正,可以滤除与分类信息无关的噪音,提高了模型的解析能力和有效性。

Question2:什么是OPLS-DA?
OPLS是一种多因变量对多自变量的回归建模方法,其最大的特点是可以去除自变量X中与分类变量Y无关的数据变异,是分类信息主要集中在一个主成分中,从而模型变的简单和易于解释,其判别效果和主成分得分图的可视化效果更加明显。正交偏最小二乘法判别分析(orthogonal partial least-squares discrimination analysis,OPLS-DA)在代谢组学分析中应用较多,利用偏最小二乘回归建立代谢物表达量与样本类别之间的关系模型,同时还可以有效分离样本,预测样品类别。
PLS-DA/OPLS-DA建立了代谢物表达量与分组关系之间的模型,PLS-DA/OPLS-DA可以更好地获取组间差异信息,还可以对样品的分组进行预测,这是PCA做不到的。

Question3:如何不使用R语言在线绘制OPLS-DA图?
小编和他的小伙伴们开发了一个在线的作图小网站——云图图(https://www.cloudtutu.com/#/index

  • 2
    点赞
  • 47
    收藏
    觉得还不错? 一键收藏
  • 1
    评论
逆滤波、维纳滤波、有约束最小二乘以及Richardson-Lucy都是图像恢复中常用的算法。 逆滤波是一种基于频域的图像恢复方法,其基本思想是通过对模糊图像进行傅里叶变换,然后将其除以模糊函数的傅里叶变换来进行逆滤波。逆滤波的优点是计算简单,但缺点是对噪声非常敏感,很容易导致图像出现伪影。 维纳滤波是一种基于频域的图像恢复方法,它通过对模糊图像进行傅里叶变换,然后将其除以包含噪声和模糊函数的傅里叶变换的加权函数来进行滤波。维纳滤波能够有效地减少伪影,但是在噪声较大的情况下可能会导致图像细节的损失。 有约束最小二乘是一种基于模型的图像恢复方法,它通过构建恢复图像的模型,并在满足一定约束条件的情况下,最小化模糊图像与模型之间的均误差来进行图像恢复。有约束最小二乘能够有效地恢复图像细节,但是需要人工设置模型和约束条件,且计算量较大。 Richardson-Lucy是一种基于迭代的图像恢复方法,它通过将模糊图像与恢复图像之间的卷积运算转换为点扩散函数的卷积运算,并利用EM算法迭代计算出恢复图像。Richardson-Lucy能够有效地恢复图像细节,但是需要迭代计算,且容易出现振铃现象。 综上所述,不同的图像恢复算法各有优缺点,需要根据具体的应用场景选择合适的算法。
评论 1
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值