物种丰度星图
星图是展现物种丰度的统计图之一,它与饼图类似,每块扇形面积大小代表物种丰度的大小,但不同的是,星图每块扇形区域的长度(半径)与该物种的丰度有关,宽度是相等的,而与常规饼图扇形的宽度才是重要的,半径大小意义不大。
如何不使用R语言绘制物种丰度星图?
云图图网站可以画!(www.cloudtutu.com,免费的哦~)
操作步骤如下:
①登录网址:www.cloudtutu.com(推荐使用360或者谷歌浏览器)
②输入用户名和密码(小编已经为大家填好了,如果不显示可添加文末二维码添加小编获取),输入验证码后即可登录;
③登录后在全部工具那一栏找到物种丰度星图,点击进入;
④请按照界面右侧的说明书或者下文进行操作~
Step 01 上传文件
※目前平台仅支持.txt(制表符分隔)文本文件或者.csv文件的文件上传。(平台可对不规范的数据格式进行部分处理,但还是请您尽量按照示例数据的格式调整数据,以便机器可以识别)
a)准备一个数据矩阵(形式参照示例数据,如微生物物种丰度表、基因表达量矩阵、代谢物含量表,也可以是测量数据,例如身高、体重、表型等);
b)表格需要带表头和列名,每一列为样本名,每一行为各