vegan稀释曲线 基因丰度_一文读懂宏基因组分析套路

宏基因组分析套路

很多朋友感觉宏基因组的分析结果内容种类太多，根本学不过来。其实本质上并不复杂，只分为两类：物种组成和功能组成两大类，它们是核心结果；再加上开头系统描述和结尾的讨论比较。通常会出现固定套路的4部分结构。

今天就从之前解读3篇CNS文章(1篇nature, 2篇science) 入手，系统总结宏基因组分析的基本思路。助力大家清楚分析思路，更多精力关注科学问题的解决，做出好结果。

文章思路和结果

文章分析思路：整体概述——物种组成——功能组成——关联/因果

文章主要结果

1. 样本、物种、功能整体内容描述(无新发现则为非重点，版面有限可放附图)

2. 物种组成整体差异和分组具体差异

3. 功能组成整体差异和分组具体差异

4. 环境因子/相关研究与微生物组的关系——关联；无菌体系验证差异物种——因果；

文章套路验证

以下是平台之前导读过的三篇宏基因组CNS文章，都是必读精品，具体内容点击下方蓝