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RSS订阅原创 PICRUSt2功能预测分析
16S高通量测序的群落数据分析中,更深层次的数据挖掘是很重要的一环,但是微生物群落标记基因测序的一个局限性就在于它无法提供有关采样群落功能组成的信息。所以我们引入了功能预测分析.“功能”通常指的是基因家族，如KEGG同源基因和酶分类号，但可以预测任何一个任意的特性。同样，预测通常基于16S rRNA基因测序数据，但也可以使用其他标记基因。正常来说,进行功能分析有多个研究方法可选:PICRUSt2 (Phylogenetic Investigation of Communities by Reconstruc
2022-06-17 15:37:42
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原创 PMA的应用
基于核酸的分子生物学检测方法，如聚合酶链式反应（Polymerase Chain Reaction，PCR），能够用于精准地分析样本中微生物的种类和丰度，但是难以区分微生物的存活状态。传统的用于检测样本中活细胞的方法都需要对样本进行培养，但是此类检测方法存在一定的局限性，无法用于检测一些难培养或是不可培养的活细胞。叠氮溴化丙锭（Propidium monoazide，PMA）是一种能与DNA结合的光反应染料，不具有细胞膜渗透性，无法穿透活细胞完整的细胞膜，只能选择性地穿透死细胞受损的细胞膜。进入细胞后，PM
2022-06-17 15:34:02
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原创 第三代测序的介绍
第三代测序技术是指单分子实时测序技术，也叫从头测序技术。与前两代测序技术相比，其最大的特点就是单分子测序，测序过程无需进行PCR扩增，实现了对每一条DNA分子的单独测序。就当前形势来看，第二代短读长测序技术在测序市场上仍然占有绝对优势，但第三代测序技术近年来也发展的如火如荼，且已应用于基因组测序、甲基化研究和突变鉴定等多个研究领域。目前主要的第三代测序技术根据测序原理的不同可分成：1. 纳米孔电信号测序：牛津纳米孔公司(Oxford Nanopore Technologies,ONT)的纳米孔单分子测序(S
2022-06-16 16:49:24
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原创 靶基因高通量测序建库流程介绍
高通量测序简单介绍：高通量测序技术（High-throughput sequencing）又称“下一代”测序技术（"Next-generation" sequencing technology），以能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般读长较短等为标志。测序平台主要包括：454焦磷酸测序（454 pyrosequencing）、Illumina (Solexa) sequencing、ABI SOLiD sequencing、离子半导体测序（Ion semiconductor sequen
2022-06-15 16:58:23
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原创 微生物分析培养介绍
微基生物微生物分离培养项目主要采用下面的流程： 实验流程和目的步骤一、原始样本微生态检测：在进行分离培养前，需要首先确认待分离的样本中是否有目标菌株，这时需要通过高通量测序的方法来检测样本中微生物的种类和相对丰度。如果希望分离细菌......
2022-06-10 15:38:59
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原创 冻干粉复苏流程
安瓿瓶的打开方法常见的用于保存菌种冻干粉的安瓿瓶有单层和双层两种，如下图1所示。图1 两种用于保存菌种冻干粉的安瓿瓶 图2 单层安瓿瓶的打开方式 图3 双层安瓿瓶的打开方式若双层安瓿瓶底部的干燥剂（蓝色硅胶珠）呈现无色或粉红色，则表明发生了泄漏，安瓿瓶内已不是真空状态，此时管内的菌种可能已经无法复苏。如果不是立即对菌种进行复苏处理，则需要将安瓿瓶存放在2-8℃冰箱中。二、菌种复苏1、根据菌株供应商提供的培养信息准备相应的固体和液体培养基......
2022-06-10 15:15:46
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原创 细菌基因组框架图
介绍细菌基因组研究，是通过基因组测序和组装，获得细菌全基因组序列，并对基因组开展结构预测，功能注释、比较基因组学及泛基因组研究。依据研究精细程度不同，分为框架图（也称为草图）、完成图（0gap），下面我们主要介绍框架图的分析内容。分析流程基本流程为，建库测序，序列优化，基因组组装，基因及结构预测，功能注释，画图展示。分析步骤与结果展示1、测序序列的质控和拼接2、组装结果评估：把 reads 比对到组装好的基因组序列上， 通过统计组装序列的 GC 含量和 reads 覆盖深度， 总结基因
2022-05-27 15:44:53
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原创 宏基因组分析-基于binning
一、介绍宏基因组 ( Metagenome) 指特定环境下所有生物遗传物质的总和。它包含了可培养的和未可培养的微生物的基因。一般从环境样品中提取基因组DNA, 进行高通量测序，从而分析微生物多样性、种群结构、功能信息、与环境之间的关系等。宏基因组的分析目前主要包括三种方法：基于组装分析、基于reads分析、基于bin分析。下面我们介绍基于bin的分析方法。二、分析流程介绍宏基因组分箱（Binning）是将序列组装得到的Contigs按物种分开归类的过程。宏基因组分箱技术有助于获得不可培养
2022-05-27 15:39:51
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原创 宏基因组分析-基于Reads比对
介绍宏基因组 ( Metagenome) 指特定环境下所有生物遗传物质的总和。它包含了可培养的和未可培养的微生物的基因。一般从环境样品中提取基因组DNA, 进行高通量测序，从而分析微生物多样性、种群结构、功能信息、与环境之间的关系等。宏基因组的分析目前主要包括三种方法：基于组装分析、基于reads分析、基于bin分析。下面我们介绍基于Reads比对的分析方法。分析流程介绍基于Reads的宏基因组分析，使用质控的优化序列与已知物种和功能数据库进行比对，从而得到每个样本的物种、功能注释信息和相对
2022-05-26 17:14:21
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原创 宏基因组分析-基于组装
一、介绍宏基因组 ( Metagenome) 指特定环境下所有生物遗传物质的总和。它包含了可培养的和未可培养的微生物的基因。一般从环境样品中提取基因组DNA, 进行高通量测序，从而分析微生物多样性、种群结构、功能信息、与环境之间的关系等。宏基因组的分析目前主要包括三种方法：基于组装分析、基于reads分析、基于bin分析。下面我们介绍基于组装的分析方法。二、分析流程介绍数据分析从下机原始序列开始，首先对原始序列进行去接头、 质量剪切以及去除污染等优化处理。然后使用优质序列进行拼接组装和基
2022-05-26 17:06:28
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原创 高通量二代测序如何建库？
第二代高通量测序也称为下一代测序技术，相比于第一代测序通量更高、速度更快、成本更低，主要有样本制备、文库构建、测序反应等过程。由于原理和技术的不同，二代测序有诸多的测序平台，目前illumina测序在高通量测序科研领域中占主导地位，接下来为大家下面详细介绍illumina平台文库构建文库构建的主要流程主要包括以下结果环节一．基因组DNA抽提质控 1.DNA提取的基本原理DNA的提取可以简单的分为裂解和纯化两大步骤，裂解是破坏样品细胞结构，从而使样品中的D...
2022-05-20 16:43:57
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原创 血液样本检测微生物的取样和保存介绍
人体表面和体内都生活着大量的微生物，包括真菌、细菌、古细菌和病毒，其总量甚至超过了人体自身细胞的数量。血液作为人体最为重要的一个组织，起到了输送氧气和营养物质、传导热量以及防止微生物感染的作用。人类的血液由54.3%的血浆、45%的红细胞、0.7%的白细胞和数量不定的血小板组成。过去曾普遍认为在健康人的血液中是不存在微生物的，只有在患有菌血症等疾病的病人血液中才有可能检测出微生物。但是近年来有越来越多的研究表明，在健康人的血液中也存在微生物，并且这些微生物与人体维持着微妙的共生关系。随着高通量测序技术逐
2022-05-20 16:40:22
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原创 噬菌体分离培养方法
噬菌体（bacteriophage, phage）是感染细菌、真菌、藻类 、放线菌或螺旋体等微生物的病毒的总称，因部分能引起宿主菌的裂解，故称为噬菌体。在葡萄球菌和志贺菌中首先发现。作为病毒的一种，噬菌体具有病毒的一些特性：个体微小，结构简单，只含一种核酸（DNA 或 RNA），必须在活细胞内寄生并以复制方式增殖。一旦离开了宿主细胞，噬菌体既不能生长，也不能复制。依据核酸类型、形态结构、基本特征等对噬菌体进行了系统的分类。（1）根据噬菌体的核酸类型，可分为双链DNA 噬菌体（即 dsDNA 噬菌体）
2022-05-19 15:19:35
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原创 菌体浓度测定方法/细菌计数方法
菌体浓度是指单位体积培养液中菌体的含量。常用的菌体浓度的测定方法（细菌计数方法）主要有以下几种：1. 直接计数法这是一种非常简单的检测方法，我们可以利用计数板或计数仪直接得出细菌数目。1.1细菌计数板首先制备细菌悬液，取一定体积的样品细菌悬液置于细菌计数板的计数池内，用显微镜观察计数。根据计数室刻度内的细菌数，计算样品中的含菌数。特点：所需设备简单，测定结果较准确，可迅速得到结果，而且在计数的同时能观察到所研究微生物的形态特征。不能区分是否为细菌，不能区分活细菌和死细菌。单位
2022-05-19 15:17:02
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原创 组织样本微生物检测介绍
人体表面和体内都生活着大量的微生物，其总量甚至超过了人体自身细胞的数量。这些微生物在与宿主长期共存的过程中，逐步形成了独特的动态微生态系统，并在人体健康和各类疾病中都扮演了重要的角色。对于组织样本中的微生物的早期研究主要采用传统的分离培养方法，来识别和描述微生物群落的组成和多样性。传统方法的局限性使研究者难以正确全面地阐明微生物的群落结构和多样性特点。而近年来发展出来的高通量测序技术从根本上改变了人们对微生物群落的认识，使人们得以系统地分析和认识组织样本中的微生物群落及其功能。基于16S rRNA /I
2022-05-13 16:33:57
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原创 皮肤样本微生物的检测介绍
从公元前400年，希波克拉底第一次描述念珠菌感染起，研究者们一直在探究与人类共生的微生物对人体健康及疾病的影响。皮肤作为人体最大的器官拥有约1.8m２的表面积，其主要功能是作为物理屏障，保护机体免受外来生物或有毒物质的侵害。同时，皮肤也是人体与外界环境接触的部位，因此常驻有各类微生物，包括细菌、真菌、病毒等。如果将皮肤看作一个生态系统，那么它就是由各类微生物和皮肤表面的组织、细胞及各种分泌物等共同组成的整体。微生物群落与皮肤表面组织之间维持着动态的平衡，这种平衡一旦被打破，就可能会引起皮肤病或感染。早期
2022-05-13 16:33:09
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原创 二代测序平台的介绍
一、测序技术的发展史高通量测序（High-Throughput Sequencing）又名下一代测序（Next Generation Sequencing，NGS），是相对于传统的Sanger测序（Sanger Sequencing）而言的。目前高通量测序的主要平台代表有罗氏公司(Roche)的454测序仪（Roch GS FLX sequencer）（已终止服务），Illumina公司的测序仪（Illumina Genome Analyzer）和ABI的SOLiD测序仪（ABI SOLiD seq
2022-05-12 16:43:27
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原创 菌种冻存方法介绍
菌种保藏是指保持微生物菌株的活力和遗传性状的技术。微生物在使用和传代过程中容易发生污染、变异甚至死亡，因而常常造成菌种的衰退。菌种保藏的目的就是使菌株存活、不丢失、不污染杂菌、不发生或少发生变异，保持菌种原有的活性和各种特征。菌种保藏的基本原理是使微生物的生命活动处于半永久性的休眠状态，也就是将微生物的新陈代谢作用限制在最低范围内。实验室常用的保菌方法有：甘油保菌法、斜面保菌法、穿刺保菌法、液体石蜡覆盖保藏法、沙土保藏法、冷冻干燥法。微基生物在以上几种菌种保藏方法的基础上，开发出了保菌效果更好瓷珠保菌法
2022-05-12 16:33:49
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原创 宏基因组生信分析方法介绍
随着高通量技术的发展，宏基因组学（metagenomics）已经成为研究微生物群落物种及功能的前沿科学，在肠道微生物、环境微生物等研究领域具有广泛应用。宏基因组学通过对微生物群落全部DNA进行高通量测序，将测序序列与公共数据库进行比对或从头组装出微生物基因组，从而识别微生物群落的物种和功能基因。目前主流的宏基因组数据分析方法包括三种：基于测序结果进行组装的分析方法；基于reads直接和已知数据库进行比对的方法；基于分箱bin的方法。常用到的分析工具见下图：一、基于组装数据分析从下机.
2022-05-10 17:06:11
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原创 宏病毒组介绍
病毒是一种个体微小，结构简单，只含一种核酸（DNA 或 RNA），必须在活细胞内寄生并以复制方式增殖的非细胞型生物。病毒是地球上丰度最高的“生物”类群，它们广泛地存在于所有已知的生态环境中，从水体，土壤再到人体，病毒无处不在。病毒能够感染所有已知的生物类型，从动物、植物到微生物，包括细菌和古菌。人体内的病毒主要包括真核病毒和噬菌体，按核酸类型，可分为双链DNA（double-stranded DNA，dsDNA）病毒，单链 DNA（single-stranded DNA ，ssDNA）病毒和RNA 病毒
2022-05-09 17:02:22
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原创 CRISPER实验介绍
一、实验流程介绍天然的CRISPR-Cas9系统由三部分组成：SpCas9 (简称Cas9)、crRNA、tracrRNA。tracrRNA（在CRISPR-Cas9编辑技术中被优化并命名为gRNA scaffold），它负责与Cas9结合，与重复序列具有同源性。crRNA为引导序列，约20个碱基，具有特异性。其中，crRNA和tracrRNA通过局部碱基配对组合并与Cas9结合后，引导Cas9识别切割目标DNA序列 (图1)。为了方便实验设计以及提高gRNA的稳定性，Jennifer Doudna和E
2022-05-06 17:08:18
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原创 qPCR定量方法在肠道微生物特定种属定量应用
大家都知道肠道中有上千种细菌，肠道微生物可参与人体代谢，促进营养物质的消化吸收，肠道微生态均衡关系到身体健康，肠道微生态失衡可能会导致疾病产生。此外有文献指出肠道微生物可能与人体免疫及炎性反应等有关。目前也越来越多人关注到疾病与肠道微生物的关系，也做了很多研究及实验，一般高通量结果得到的是每个物种在样本中的相对百分含量，而不同微生物的绝对含量其实也对疾病有很重要的影响。在此分享几篇有采用qPCR方法研究疾病与肠道微生物关系的文章。早在2013年Kim-Anne Lê1、Yan Li等人发表文章Alter
2022-05-06 17:04:01
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原创 荧光定量PCR介绍
什么是qPCRqPCR也叫Real-time Quantitativ PCR，即实时荧光定量核酸扩增检测系统，就是在PCR扩增过程中，通过荧光信号，对PCR进程进行实时监测，以此实现在对初始模板的定量分析。qPCR分类根据Real-time qPCR 的化学发光原理可以分为2大类: 一类为非探针类，其中包括如SYBR@Green I染料法等，通过染料来指示扩增产物的增加。一类为探针类，包括TaqMan探针和分子信标，利用与靶序列特异杂交的探针来指示扩增产物的增加。1、SYBRGreenⅠ染料..
2022-05-05 16:16:44
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原创 生殖道微生物的采集保存方法
生殖道样本特指阴道微生物的采集及自采集，其他生殖部位的样本采集需由妇科医生进行。1 样本的采集采集前注意至少近一周没有口服或局部使用抗生素，近一个月未口服或局部使用雌、孕激素，近3天没有性生活、无盆浴、阴道冲洗或阴道用药；未在经期。取样前将无菌拭子在取样部位擦拭10-20次，并在擦拭过程中旋转拭子，使采样部位的微生物均匀附着在拭子头部。采集完成后，将采集拭子头放入含保存液的保存管除,在折痕处折断,保留拭子头在保存管中，丢弃拭子柄。盖上保存管盖子,手动上下震荡 10-20次，使保存液充分浸润拭子头。取
2022-04-29 15:22:28
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原创 皮肤微生物的采集保存方法
根据实验的目的，确定选择受试者的条件，如考虑年龄、身体健康、有无特殊疾病等因素。根据考虑的因素，选择符合条件的受试者。向受试者交代实验的目的、过程、风险、收益及退出机制等，确保受试者理解全部实验内容，待受试者签订知情同意书后开始取样。1 样本的采集用采集拭子采集皮肤表面的微生物，取样时，握拭子的手请靠近拭子头部， 请勿超过折断处，以免污染样本。正常皮肤建议取样面积采用 5cm*5cm，最小取样面积需大于 4cm* 4cm。裸露皮肤（脸、手）微生物较为丰富，遮盖部位（腹 部、小腿）皮肤微生物数量较少，
2022-04-29 15:21:57
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原创 口腔微生物的采集保存方法
样本的采集方法往往影响着后续的实验结果。微基生物搜集了多篇文献，将人体牙菌斑、唾液、痰液、舌苔的微生物的采集方法进行了汇总。下述采集方法仅供参考，具体实验的采集方法，还需根据实验进行具体设定。根据实验的目的，确定选择受试者的条件，如考虑年龄、身体健康、牙齿数量、牙齿健康状况、有无特殊疾病等因素。根据考虑的因素，选择符合条件的受试者。向受试者交代实验的目的、过程、风险、收益及退出机制等，确保受试者理解全部实验内容，待受试者签订知情同意书后开始取样。1 样本的采集1.1 牙菌斑受试者无其他口腔疾
2022-04-28 15:08:10
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原创 肠道菌群检测粪便样本的采集保存方法
1 样本的采集1.1 人粪便样本的采集根据实验的目的，确定选择受试者的条件，如年龄、体重、糖尿病、身体健康状况、有无特殊疾病等因素。根据考虑的因素，选择符合条件的受试者。向受试者交代实验的目的、过程、风险、收益及退出机制等，确保受试者理解全部实验内容，待受试者签订知情同意书后开始取样。让受试者将粪便排泄到干净的容器中，尽量避免尿液、马桶壁等对粪便样本的污染。粪便要采集新鲜的，建议采集排泄中后部的粪便，并尽量挖取中部内侧的粪便作为样本。用无菌勺对新鲜的粪便进行挖取，将粪便样本放入无菌保存管中，样本
2022-04-28 15:07:34
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原创 高通量培养组学筛选
目前二代高通量测序已经成为研究人体、动物、植物等菌群结构常用的一种方法，该方法仅仅可以得到样本中微生物的种类和相对丰度，而无法拿到具体菌株。微基生物专注微生态研究和应用，不仅具有二代高通量测序平台，而且还建立了菌群需氧/厌氧分离培养平台，为客户提供高效的需氧/厌氧菌的非靶向分离培养服务，帮助客户获得粪便、肠道、土壤、淤泥等样本中大多数菌株。可培养样本可培养粪便、肠道组织、土壤、淤泥、植物、药品等样本中微生物样本保存和运输在采样之前，微基生物先给客户寄送厌氧或需氧保存液，客户可..
2022-04-27 16:42:24
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原创 特定菌种分离培养
目前二代高通量测序已经成为研究肠道菌群结构常用的一种方法，该方法仅仅可以得到样本中微生物的种类和相对丰度，但是无法拿到具体菌株。微基生物专注微生态研究和应用，不仅具有二代高通量测序平台，而且还建立了肠道菌群需氧/厌氧分离培养平台，为客户提供高效的需氧/厌氧菌的靶向分离培养服务，帮助客户获得特定菌株。可培养的样本人或动物的粪便样本土壤、淤泥等环境样本目标菌株特定数量的特定菌株，比如一株或两株菌样本保存和寄送在客户取样之前，微基生物为客户提供厌氧活菌保存液，客户将
2022-04-27 16:41:34
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原创 特定功能微生物多样性分析
——基于功能基因/持家基因/靶基因在自然界的各类环境中，都有微生物的存在，它们在各自的“岗位”上都发挥着或大或小、或多或少的作用。有一些具有特殊功能的微生物，由于其作用的重要性或特殊性而受到人们的广泛关注，这些具有特殊功能的微生物叫做功能微生物，如氨氧化细菌、硫细菌、硝化细菌等。它们在分类学上有可能差异很大，但却具有相同或类似的基因使其能够发挥同样的作用。支配这些功能细菌发挥重要功能的基因被称为功能基因，如amoA、dsrB、nxrA。目前微基生物已收集GeneBank中所有已知功能基因的序列及其对应的
2022-04-26 17:30:23
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原创 水体微生物多样性分析
微基生物基于16S rRNA基因、18S rRNA基因和ITS序列，利用NGS测序技术（illumina、Ion Torrent PGM）来分析水源（包括河水、湖水、冰川融水、海水等）微生物（包括原核微生物、真核微生物）的多样性，解析不同环境样本中的微生物多样性差异，同时，第二代高通量测序拥有庞大的数据信息，更能进一步统计分析出不同的水源环境中影响微生物群落及多样性的主要因素。水体中微生物种类繁多，数量巨大，通过对水体微生物的种群结构和多样性进行解析并研究其动态变化，即可为充分了解水源微生物组成、优化群落结
2022-04-22 14:53:05
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原创 生殖道微生态研究
生殖道内微生态环境对妇女健康、生殖功能、婴儿出生等都有重要的作用。微生物导致生殖道环境产生某些生化或炎症反应，生育期健康女性的阴道内有大量正常寄生菌，他们通过自身产生的粘附机制与阴道上皮细胞结合，生长于阴道粘膜表面。其菌群的平衡至关重要，其不仅影响着其中定殖微生物类群，也影响着阴道内环境。而一旦受到某些因素的影响，如体内雌激素含量的变化、致病菌的侵入、长期服用抗生素等，就会使阴道pH值发发生改变，破坏阴道的自然防护，其内部的菌群失衡，就会产生相应的疾病。微基生物运用分子生物学结合高通量测序的方法，可以得
2022-04-22 14:50:37
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原创 口腔与呼吸道微生物多样性
口腔微生物口腔是人体微生物定植生存的重要生态区，口腔微生物不仅有细菌，还包括真菌、病毒、螺旋体及古细菌等。口腔内环境稳态易受外界因素的干扰，口腔内部有多位点、多层次的微生物定植生态区，口腔环境的异质性较肠道更为明显。正常情况下口腔微生物群落之间、微生物与宿主之间密切且复杂的相互作用维持着宿主健康，这种生态平衡被打破将会引发疾病。口腔主要疾病如龋病、牙周病及口腔癌等严重影响人类的生命健康。基于16S rDNA/18S rDNA基因，优化实验方法，增加对痕量微生物的研究，利用高通量测序技术（illu
2022-04-20 17:43:02
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原创 土壤微生物多样性分析
微基生物提供土壤微生物多样性分析的整体科研服务：实验规划->样本采集保存->分子实验->生信统计分析->论文协助微基生物采用高通量测序、PCR-DGGE、实时荧光定量PCR等方法，对样本中的DNA进行序列测定，并通过生信统计分析，对大量数据进行处理，揭示肠道中微生物的种类以及它们之间的相对丰度和进化关系，探讨微生物多样性，研究土壤微生物与环境间的相关关系。技术路线：高通量分析流程PCR-DGGE分析流程检测平台： 微基生物拥有Illumina .
2022-04-19 15:23:20
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原创 肠道微生态研究
肠道微生物也就是我们所说的“肠道菌群”，其数量超过人体自身细胞的10倍以上，对营养物质代谢、人体自身发育、免疫及疾病的产生等方面都起到极其重要的作用。很多研究结果都表明肠道微生物和多种疾病发病直接相关，比如癌症、肥胖、神经变性疾病等。目前微基生物已与中科院、北京大学、清华大学、长征医院、红房子医院等多所高校科研院所和三甲医院合作，已检测过人、小鼠、大鼠、猴子等多种动物的粪便及肠道内容物。微基生物可采用二代高通量测序、三代高通量测序、PCR-DGGE等方法，对样本中微生物的DNA进行测定，并通过生信统计分
2022-04-19 15:09:33
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原创 抗性基因定量检测
抗性基因即抗性的遗传因子，是选择基因的一种。目前由于大量抗生素在人类医药业、畜牧养殖业滥用，导致了人体或动物体内抗生素抗性基因(ARGs)的产生，不可避免的导致耐药微生物和抗性基因的增加和扩散，引起一系列污染和生态风险。作为21世纪一类新兴污染物，抗性基因的污染水平已经远远超过我们的预想。因此对人体、土壤等样本中抗性基因的分布水平、扩散传播及消减技术的研究，刻不容缓。微基生物可以提供抗性基因的定量检测服务。1 检测样本粪便、水样、土壤、雾霾、细菌等若客户提供DNA，建议客户记录抽提DNA时样
2022-04-18 15:22:25
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原创 特定功能基因定量检测
1 检测对象特定功能基因指的是具有某种特定作用的酶的编码基因，通过对该酶的基因进行qPCR定量，来确定该基因在样本中的拷贝数。目前研究较多的主要是氮循环、碳循环、硫循环、砷循环等相关的功能基因。微基生物可以利用qPCR定量检测样本中的碳循环、氮循环、硫循环等过程中的功能基因。氮循环相关氮是生命体核酸与蛋白质必不可少的组成元素。氮素的生物地球化学循环(氮循环)对生命的存在和持续有关键作用，本质上是微生物驱动的氮素转化、利用及循环的过程。氮循环就是指N2、无机氮化合物、有机氮化合物在自然界中..
2022-04-15 15:02:07
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原创 ddPCR 数字PCR检测服务
数字PCR即Digital PCR（dPCR)，它是一种核酸分子绝对定量技术。相较于传统的qPCR，数字PCR可让你能够直接数出DNA分子的个数，是对起始样品的绝对定量。数字PCR是最新的定量技术，基于单分子PCR方法来进行计数的核酸定量，是一种绝对定量的方法。主要采用当前分析化学热门研究领域的微滴化方法，将大量稀释后的核酸溶液分散至芯片的微滴中，每个反应器的核酸模板数少于或者等于1个。这样经过PCR循环之后，有一个核酸分子模板的反应器就会给出荧光信号，没有模板的反应器就没有荧光信号。根据相对比例和反应
2022-04-14 14:32:55
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原创 引物设计&验证
针对日益研究火热的微生物，微基生物新推出qPCR引物设计及验证，可以提供细菌菌株、菌种、菌属特异性qPCR检测引物设计及验证。客户提供信息对于菌株特异性qPCR引物设计服务，客户需提供该菌株拉丁文全名或该菌株的测序结果（建议提供全序列而非16S全长序列）。对于菌属特异性qPCR引物设计服务，客户需提供属的拉丁文全名。服务流程1 通过查询菌株或菌属的序列信息，构建目的菌群全基因组数据库；2 设计特异性引物3 特异性引物合成、验证及优化4菌株/菌属特异性qPCR大规...
2022-04-14 14:31:47
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