gsea结果分析图怎么看_如何使用 GSEA 进行数据分析？

在本篇文章中，将利用 GSEA 官网提供的数据集，介绍如何使用该软件进行分析数据。

一、打开软件，在软件左上角 Download Example datasets，或者直接去该网站进行下载。

http://www.gsea-msigdb.org/gsea/datasets.jsp

在这里，我们将使用 p53 的数据进行分析，将图中红框的三个文件都下载到本地，这三个文件为携带 p53 突变与野生型表达谱、表型文件。在下载数据的时候，首先需要先进行注册，注册只需要邮箱，很简单就能完成。

二、下载完成之后，再回到软件首页，在软件左上角，点击 load data，将刚才下载的三个文件上传。

注意：上传的数据在格式上是有要求的，这个在 GSEA 官网上有说明

点击 load data 之后，右边的界面会出现下图所示画面：

1. 通过浏览电脑本地文件夹上传文件；

2. 上传最近使用过的数据(第一次使用时不会用到这个方法上传数据)；

3. 直接将数据直接拖过来；

4. 对上传的数据类型的具体格式有详细的要求，因此要按照软件要求格式上传数据；

我是直接将下载的数据直接拖进来，然后点击「Load these files!」