R语言多层桑基图_ceRNA关系网络冲击图—桑基图（R语言绘制）

原标题：ceRNA关系网络冲击图—桑基图(R语言绘制)

在ceRNA相关的研究中，例如circRNA-miRNA-mRNA，或者lncRNA-miRNA-mRNA的靶向关系图谱，一般通过网络图呈现。首先可以肯定的是，网络图是一种清晰展示ceRNA网络结构的有效方法。

文献中的ceRNA网络图示例

不过同一种类型的图见多了，多少会产生一些审美疲劳。那么，有没有其它的可替代方案呢？本篇则给大家带来一种别致的画风，使用冲击图(或桑基图)代替网络图描述ceRNA网络。

例如文献“Construction and comprehensive analysis of a ceRNA network to reveal potential prognostic biomarkers for hepatocellular carcinoma”中描述lncRNA-miRNA-mRNA关系的ceRNA冲击图。

文献中的ceRNA冲击图

冲击图(alluvial)、桑基图(sankey)，名称傻傻分不清倒也没关系，很多情况下可以当作一类来看待。如何，上图中3者间的结构是不是也很清晰？如果您也心动了，下面就让我们重现该文献的样式，绘制冲击图展示ceRNA关系。

在原文献附录中，作者提供了上图lncRNA-miRNA-mRNA靶向关系的原始数据，可以直接在原文中获取。为了方便大家操作，我们已经下载了数据做了本地整理，并和R代码等一起打包，可添加微信公众号获取。

示例文件

示例文件一共两个，“lncRNA_miRNA.txt”记录了