GATK软件安装
搜索github,自行下载最新版本
Releases · broadinstitute/gatk (github.com)
右键点击复制链接然后下载
cd biosoft
proxy_on # 开启终端代理
wget -c https://github.com/broadinstitute/gatk/releases/download/4.1.9.0/gatk-4.1.9.0.zip
# 因为我安装了zsh,如果是bash的话,请使用unzip
# 如果没有unzip,则先下载
# sudo apt install unzip
x gatk-4.1.9.0.zip
mv gatk-4.1.9.0 gatk #改一下名字
#添加环境变量
vim ~/.zshrc
export PATH=/home/yuansh/biosoft/gatk:$PATH
# 运行显示下面的东西则安装完毕
gatk