基因组实战02: 软件安装和GATK数据下载

最新推荐文章于 2023-05-10 16:03:59 发布

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本文介绍了如何在中国通过FTP和Google Cloud下载GATK的基因组数据，以及如何准备运行环境，包括设置Python 2和Python 3。

摘要由CSDN通过智能技术生成

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download the genomics data of GATK

https://gatk.broadinstitute.org/hc/en-us/articles/360035890811-Resource-bundle

two slow in China (23.0K/s)

# install lftp
sudo apt -y install lftp
# login into the ftp server; no password (just enter)
lftp ftp://gsapubftp-anonymous@ftp.broadinstitute.org/bundle/

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