DAVID由于数据库更新不及时，导致其用于GO和KEGG等生物信息学分析的准确性受到质疑。2016年前的7年间，DAVID未更新数据库，影响了分析结果的准确性。文章推荐使用基于R语言的ClusterProfiler作为替代工具，并指出在蛋白质组研究中，QuickGO可能优于DAVID提供的GO数据。过时的分析工具可能导致有意义的通路被忽视，如免疫反应和Notch信号通路。因此，使用最新数据库进行功能分析至关重要。
原文转自 质谱和蛋白质组学
不管是核酸类组学还是蛋白质组，我们再发表的文章中，以及硕士、博士毕业论文中，包括很多中文学位论文中，大量的人依旧在使用DAVID做生信分析(GO、KEGG等)。不可否认的是，DAVID的功能丰度和易用性上确实很出众，但是好不好用只是一个次要的东西，更重要性的东西是：它准不准？
在这里，准不准的核心要素就是数据库更新的及时还是不及时。
DAVID的更新不是很及时：
我们惊讶的发现，从2010年年初一直到2016年10月，接近7年的时间里，DAVID一直没有更新数据库。可想而知，在这七年的时间里，那些用DAVID做生信分析的组学文章里，有多少结论是错误的，漏掉了多少有价值的信息。
那么，为什么DAVID会突然在16年10月更新数据库呢？因为被骂了。
16年9月有人在《Nature Methods》上发文章痛批以DAVID为代表的工具误人子弟。
……
不过即便是16年10月的更新，依旧是老旧的，因为KEGG从12年开始就不再提供数据库的下载，日本人也不是无限的财大气粗。至于GO数据库，目前的两大GO数据库来源，Amigo和QuickGO，可是一直在更新数据库。而DAVID的GO数据库还停留在16年10月。
这里多说一点，如果你研究的是蛋白质组，我建议做GO的话还是用QuickGO的数据最好，我不太建议使用GO官网数据库。至于为什么，以后本公众号会有一篇专门的文章阐述。
既然DAVID的数据库更新
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