在进行差异基因表达分析时,得到显著差异基因后,接下来就需要分析这些基因参与了哪些功能,常见的就是GO功能注释和KEGG通路富集分析,今天为大家介绍在线分析工具的使用——DAVID与KOBAS 3.0。
DAVID是一个生物信息数据库,其整合了生物学数据和分析工具,为大规模的基因或蛋白列表提供系统综合的生物功能注释信息,帮助用户从中提取生物学信息。目前DAVID数据库主要用于差异基因的功能和通路富集分析。
KOBAS是一个被广泛用于基因/蛋白质功能注释和功能集富集的网页版数据库。使用者在给定一组基因或蛋白质,该数据库可以确定某些通路和基因本体论(GO)是否有统计学显着性。Step 1:打开网站https://david.ncifcrf.gov/,进入DAVID首页,然后点击Start Analysis;
Step 2:输入所需要富集的显著差异基因的基因名,并在select identifier中选择official_gene_symbol,然后在List type中选择gene list,最后点击submit list;