有参组装新转录本cufflinks_叶片衰老期间，油茶的生理特性和转录组分析

Physiological Characterization and Transcriptome Analysis of Camellia oleifera Abel. during Leaf Senescence

油茶树是一种常绿小乔木，具有很高的经济价值，可生产食用油，以其高含量的不饱和脂肪酸而闻名。从果实中提取的茶油的产量形成源自叶片，因此叶片衰老是叶片发育的最后阶段，是影响茶油产量和品质的重要农艺性状。然而，对油茶的叶片衰老的生理特性和分子机制了解得很少。

在这项研究中，作者对油茶的一年生叶片和两年生叶片进行了生理观察和从头转录组组装。生理测定表明，衰老叶片中叶绿素(Chl)，可溶性蛋白和抗氧化酶(包括超氧化物歧化酶，过氧化物歧化酶和过氧化氢酶)的含量显着降低，脯氨酸和丙二醛浓度升高。

通过分析RNA-Seq数据，作者在两年生叶片中鉴定出4645个差异显着的单基因(DEG)，其与类黄酮和苯丙烷类生物合成以及苯丙氨酸代谢途径最相关。在这些DEG中，包括NOL，ATAF1，MDAR和SAG12在内的77个衰老相关基因(SAG)被分类为与Chl降解，植物激素和氧化途径有关。基于Spearman相关算法对77种SAG的进一步分析表明，这些SAG之间存在显着的表达相关性，表明SAG之间可能共同调控叶片衰老。在叶片衰老过程中鉴定出的总共162个差异表达转录因子(TF)大部分分布在MYB(成髓细胞病)，ERF(乙烯响应因子)，WRKY和NAC(NAM，ATAF1 / 2和CUCU2)家族中。另外，对19种假定的SAG的qRT-PCR分析与RNA-Seq数据一致，进一步证实了RNA-Seq的可靠性和准确性。

意义：本研究提供了两种年龄的油茶叶片转录组分析的第一份报告，并为了解叶片衰老的分子机制提供了基础。

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