三代测序之全长转录本

三代测序之全长转录本

2016-05-20    编辑：诺禾致源

全长转录本

产品优势

• 直接获得 mRNA 全长序列及完整结构信息

• 对无参物种，彻底解决拼接较短、信息不完整难题

• 对有参物种，可获得更精确的可变剪切（AS）、表达定量等信息

研究方案

全长转录本测序结合二代测序，精准完成有参、无参转录组定量及结构分析，如图6。

图6 测序及分析流程

研究案例

二代联合三代测序深入解析丹参根组织中转录本结构及表达水平信息

丹参为重要的药用植物，根部入药，研究其根部基因转录组本及表达信息对丹参的应用有重要意义。作者利用二代测序结合三代全长转录本测序，获得了丹参根特别是丹参皮中全部转录本信息；发现约有40％的基因发生可变剪切，且部分参与生成类异戊二烯和萜类化合物的代谢过程。

图7 不同测序平台转录本长度分布比较

注：目前诺禾致源项目数据分析结果与国际主流杂志已发表结果趋势一致，数据质量和分析可满足科研需求

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研究案例

PacBio RS
构建4个文库（<1,1-2,2-3,>3Kb）
2 cell /文库
数据量：5G/sample

Illumina
HiSeq 2000/2500
PE100
数据量：10G/sample