Conda下载生物信息学工具

文章目录

• • 概要
  • 整体架构流程
  • 技术名词解释
  • 技术细节
  • 小结

每次下载软件都要先创建环境

conda activate rna

sra-tools

conda install -c bioconda sra-tools

这条命令会告诉Conda从Bioconda渠道安装SRA Toolkit。Bioconda是一个专门用于生物信息学软件包的Conda渠道，提供了许多常用的生物信息学工具和软件包。执行上述命令后，Conda会自动下载并安装SRA Toolkit到当前的Conda环境中。

STAR

#在 Ubuntu 上安装 Git
sudo apt update
sudo apt install git
#使用 Git 工具从 STAR 的 GitHub 仓库中克隆代码到您的当前目录下
git clone https://github.com/alexdobin/STAR.git
# STAR（RNA-Seq比对工具）